Title: 《Collection of non-meconium stool on fecal occult blood cards is an effective method for fecal microbiota studies in infants》 Microbiome, 2017

研究目標(biāo)：（1）糞便潛血檢測(cè)卡能否替代常規(guī)采樣方法？

                    （2）不同的采樣裝置、保存溫度和保存時(shí)間對(duì)腸道菌群鑒定的影響

研究對(duì)象：8名兒童的糞便樣本，采用不同采樣裝置重復(fù)采樣，分別在不同溫度保存不同時(shí)間后提取DNA。

采樣裝置： 糞便潛血檢測(cè)卡（FOBT） vs Eppendorf管

保存溫度：常溫 vs 零下80度

保存時(shí)間：0-2天 vs 3-5天 vs 7天

核酸提取方法：手工法（Qiagen Qiamp DNA stool mini kit） vs 自動(dòng)法（Qiagen，Valencia，CA）

取樣情況詳見下表

結(jié)果一：

不同的保存方法各指標(biāo)間具有顯著的差異（糞便潛血檢測(cè)卡FOBT vs Eppendorf管）

結(jié)果二： 

不同保存條件對(duì)腸道菌群的影響主要表現(xiàn)在特定菌屬的豐度變化。

在嬰兒胎糞和糞便中厚壁菌門（Firmicutes）和變形菌門（Proteobacteria）都占主要部分（86%~99%）。相比于保存于tb管中的樣本，保存在檢測(cè)卡中的糞便樣本中厚壁菌門發(fā)生了顯著的升高，而變形菌門發(fā)生了顯著的降低。此外，在不同的保存容器中，嗜血桿菌屬的豐度也有顯著差別。

微微碎碎念：有些失望的結(jié)果。作為檢測(cè)卡，F(xiàn)OBT體積小，易保存，取樣量少，實(shí)在是很值得期待的臨床應(yīng)用取樣容器。不過(guò)這結(jié)果說(shuō)真的，也是意料之中了。再次證實(shí)了，保存時(shí)間、保存溫度、保存裝置都對(duì)微生態(tài)菌群結(jié)構(gòu)具有影響！ 研究過(guò)程中需小心，小心，再小心！