腸道微生物群組成和功能的改變與多種疾病有關，包括胃腸道和代謝疾病以及精神障礙。腸道細菌和微生物途徑對宿主代謝和免疫的影響，以及微生物群可以改變的事實，提高了人們對開發(fā)微生物組靶向療法的興趣。多種微生物組靶向療法目前正在臨床試驗中，然而，健康微生物組的特征在很大程度上尚不清楚。此外，定義健康微生物組的能力受到研究之間糞便樣本處理差異以及微生物組組成中巨大的個體間差異的阻礙，而對具有明確表型的大型標準化隊列進行深入的綜合分析仍然較少。近日，來自格羅寧根大學和格羅寧根大學醫(yī)學中心的學者發(fā)表在Nature上發(fā)表的學術論文研究了遺傳因素、暴露因素、生活方式和飲食如何塑造健康和疾病中的微生物組。

在本研究中，研究人員分析了來自2756個家庭的三代隊列中的8208名荷蘭個體的腸道微生物組中的細菌組成、功能、抗生素耐藥性和毒力因子。該樣本量覆蓋了自舉分析估計的微生物功能特征總數(shù)的90%以上。他們將這些與241個宿主和環(huán)境因素相關聯(lián)，包括身心健康、藥物使用、飲食、社會經(jīng)濟因素以及兒童和當前暴露體。

研究發(fā)現(xiàn)，腸道微生物群的組成在整個人群中變化很大，例如擬桿菌的相對豐度從5%到95%以上不等，鑒定了九種核心物種（Subdoligranulum sp.，Alistipes onderdonkii，Alistipes putredinis，Alistipes shahii，Bacteroides uniformis，Bacteroides vulgatus，Eubacterium rectale，Faecalibacterium prausnitzii和Oscillibacter sp.）。微生物組主要由環(huán)境和同居性塑造。只有約6.6%的類群是可遺傳的，而約48.6%的類群的方差可以通過同居來顯著解釋。研究鑒定了微生物組與健康之間的2856種關聯(lián)，其中1206個與細菌分類群的顯著關聯(lián)，1182個與微生物途徑，390個與抗生素抗性基因和76個與細菌毒力因子的顯著關聯(lián)，發(fā)現(xiàn)看似無關的疾病具有與合并癥無關的共同微生物組特征。此外，研究人員確定了微生物組特征與飲食，發(fā)現(xiàn)社會經(jīng)濟和早期生活以及當前暴露組之間的7519種關聯(lián)，其中許多早期和當前因素與微生物組功能和組成顯著相關。

圖 與疾病類別和健康狀況相關的微生物組特征

總之，該研究全面概述了腸道微生物組以及遺傳性和暴露的潛在影響，這將促進微生物組靶向治療的未來發(fā)展。

參考文獻：Gacesa, R., Kurilshikov, A., Vich Vila, A. et al. Environmental factors shaping the gut microbiome in a Dutch population. Nature (2022). https:///10.1038/s41586-022-04567-7