面對癌癥，腫瘤學家面臨著過度治療和治療不足的雙重流行病，治療疾病的過程中往往涉及苛刻的化療和其它會產(chǎn)生廣泛副作用的干預措施，因此，臨床醫(yī)生或許會推遲治療一種看起來無害的腫瘤，而直到其變得威脅到生命時或許治療就為時已晚了，或者他們可以選擇利用一種嚴格的療法來治療不太具有侵襲性的癌癥，這樣就會對患者產(chǎn)生的害處大于益處。

哪種遺傳改變或能預測患者最大的癌癥死亡風險？

圖片來源：Cell Reports (2022). DOI: 10.1016/j.celrep.2022.110569

近日，一篇發(fā)表在國際雜志Cell Reports上題為“Genome-wide identification and analysis of prognostic features in human cancers”的研究報告中，來自耶魯大學醫(yī)學院等機構的科學家們通過研究分析了33中不同人類癌癥的分子特征，旨在尋找到一種區(qū)分無威脅和侵襲性疾病的方法。

研究者Sheltzer表示，這項研究中，我們首次對幾十種癌癥類型中致命和相對無害的人類癌癥之間的遺傳差異進行全面的分析和理解；識別出癌癥中的預后生物標志物或許能幫助臨床醫(yī)生評估哪些癌癥患者最有可能發(fā)展為惡性侵襲性的癌癥，但盡管研究人員收集了大量的基因組數(shù)據(jù)來用于癌癥研究，但講這些數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)化為具有可操作性的臨床見解或許一直非常困難。

2006年，美國國家癌癥研究所和國家人類基因組研究中心開始了一項大規(guī)模、多年的稱之為“癌癥基因組圖譜計劃”的研究計劃，該計劃招募了10,884名患有33種不同癌癥類型的患者，同時對這些患者機體的腫瘤進行了特殊的分子分析，研究者的分析數(shù)據(jù)包括腫瘤的基因表達、突變、拷貝數(shù)變異、DNA甲基化、microRNA表達和蛋白質(zhì)表達等。此外，他們還收集了患者臨床治療過程的一些信息（無論其是術后存活的幾個月里還是很多年），這項研究中，研究人員將這兩部分數(shù)據(jù)結(jié)合在了一起進行分析。

文章中，研究人員評估了是否癌變腫瘤中存在的任何基因組生物標志物與不同患者較短或較長的生存時間有關，同時該研究還產(chǎn)生了一些令人驚訝的結(jié)果，比如，癌癥研究人員非常感興趣利用一些來自特定癌癥突變的相關數(shù)據(jù)作為一種潛在的預后生物標志物，他們認為，癌癥中攜帶特定基因突變的患者或許會經(jīng)歷更糟糕的治療結(jié)局，因此就更需要密切監(jiān)測這些患者，然而本文研究數(shù)據(jù)卻表明，突變或許在癌癥中似乎并沒有太大的預后意義。

圖片來源：https://www./cell-reports/fulltext/S2211-1247(22)00313-8?_returnURL=https%3A%2F%2Flinkinghub.elsevier.com%2Fretrieve%2Fpii%2FS2211124722003138%3Fshowall%3Dtrue

相比之下，研究者發(fā)現(xiàn)，拷貝數(shù)的變異或許具有高度的預后性，且與多種類型癌癥患者的治療結(jié)局密切相關，人類機體的大部分細胞都含有23對染色體，在癌癥中，拷貝數(shù)變異更趨向于在細胞獲得或失去染色體時發(fā)生，從而就會導致基因的數(shù)量增加或減少；未來研究人員將會更加關注基因和染色體中所發(fā)生的拷貝數(shù)變異，以及其為何會與癌癥患者的死亡直接相關。

研究者Sheltzer說道，一個令人驚訝的發(fā)現(xiàn)就是，突變或許傳達了相對較少的信息，但來自癌癥的其它類型的基因組測量，尤其是拷貝數(shù)的測定或許就含有大量的預后信息；此外，研究人員還專門建立了一個門戶網(wǎng)站，其允許科學家們對其所分析的結(jié)果進行分析，他們希望本文研究結(jié)果或能幫助臨床醫(yī)生正確識別出并不需要密集治療的癌癥類型，以及需要進行嚴格干預的危及生命的癌癥類型。

本文研究或許有望幫助改善最需要治療的癌癥患者得到及時的治療。綜上，本文研究中，研究人員的分析貨位預后生物標志物的分析建立了一種非常豐富的資源庫，同時還闡明了患者的生存數(shù)據(jù)在臨床前癌癥研究和療法開發(fā)過程中的用途和價值。（生物谷Bioon.com）

原始出處：

Joan C. Smith，Jason M. Sheltzer. Genome-wide identification and analysis of prognostic features in human cancers, Cell Reports (2022). DOI: 10.1016/j.celrep.2022.110569