針對(duì)自然人股東持有被投資企業(yè)的股權(quán)，在被投資企業(yè)的股權(quán)增值后，自然人股東在轉(zhuǎn)讓持有的股權(quán)后獲得的溢價(jià)金額需要繳納20%的個(gè)人所得稅的情況，比如被投資企業(yè)成功掛牌新三板甚至是上市后，其股權(quán)的價(jià)值暴增幾十倍，那么自然人股東轉(zhuǎn)讓該股權(quán)獲得的巨額股權(quán)溢價(jià)，就需要繳納高昂的個(gè)人所得稅，針對(duì)這種情況，而采取的在稅收洼地成立個(gè)人獨(dú)資企業(yè)或合伙企業(yè)取代自然人的股東身份，持有被投資企業(yè)的股權(quán)的個(gè)人所得稅稅收籌劃方式，從此以后不再有效，相應(yīng)的方案徹底作廢！

也就是，針對(duì)自然人股東身份轉(zhuǎn)讓持有的股權(quán)，需要繳納高昂的個(gè)人所得稅的情況，通常使用的個(gè)人所得稅稅收籌劃方案為：在稅收洼地注冊(cè)一家個(gè)人獨(dú)資企業(yè)，以該個(gè)獨(dú)企業(yè)取代自然人股東的身份而持有被投資企業(yè)的股權(quán)，那么在今后被投資企業(yè)的股權(quán)增值后，個(gè)獨(dú)企業(yè)轉(zhuǎn)讓該股權(quán)獲得的溢價(jià)金額，就可以按照稅收洼地的核定征收政策，按10%核定其應(yīng)納稅所得，適用5%~35%的個(gè)人所得稅稅率，也就是，只需按0.5%~3.5%的稅率繳納個(gè)人所得稅，遠(yuǎn)遠(yuǎn)低于按20%的稅率繳納的個(gè)人所得稅。

同理，針對(duì)員工持有有限公司的股權(quán)的情況，通常采用的個(gè)人所得稅稅收籌劃方案，也是在稅收洼地注冊(cè)一家合伙企業(yè)作為員工的持股平臺(tái)持有有限公司的股權(quán)，那么，在該有限公司的股權(quán)增值后，該合伙企業(yè)因?yàn)檗D(zhuǎn)讓持有的該股權(quán)而獲得的溢價(jià)金額，就只需按照稅收洼地的核定征收政策繳納0.5%~3.5%的個(gè)人所得稅即可。

以上兩種專門針對(duì)自然人持股需要繳納高昂的個(gè)人所得稅的稅收籌劃方案，合法合理地降低了個(gè)人所得稅稅負(fù)。

主要的法律依據(jù)是：財(cái)稅[2000]91號(hào)《關(guān)于個(gè)人獨(dú)資企業(yè)和合伙企業(yè)投資者征收個(gè)人所得稅的規(guī)定》第七條規(guī)定“個(gè)人獨(dú)資企業(yè)和合伙企業(yè)的生產(chǎn)經(jīng)營所得可以采取核定征收方式征收個(gè)人所得稅”，和國稅發(fā)[2011]50號(hào)《關(guān)于切實(shí)加強(qiáng)高收入者個(gè)人所得稅征管的通知》的規(guī)定“對(duì)個(gè)人獨(dú)資企業(yè)和合伙企業(yè)從事股權(quán)（票）交易取得的所得，全部納入生產(chǎn)經(jīng)營所得，依法征收個(gè)人所得稅?！?/span>

但是，就在2021年年底的最后一天，2021年12月30日，財(cái)政部和國家稅務(wù)總局聯(lián)合發(fā)布了公告2021年第41號(hào)《關(guān)于權(quán)益性投資經(jīng)營所得個(gè)人所得稅征收管理的公告》，使得前述這種個(gè)人所得稅稅收籌劃的操作徹底無效，方案徹底作廢！

財(cái)政部稅務(wù)總局公告2021年第41號(hào)第一條明確規(guī)定：持有股權(quán)、股票、合伙企業(yè)財(cái)產(chǎn)份額等權(quán)益性投資的個(gè)人獨(dú)資企業(yè)、合伙企業(yè)，(不再適用核定征收的方式），而一律適用查賬征收方式計(jì)征個(gè)人所得稅，且自2022年1月1日起施行。

也就是，自此以后，凡是個(gè)人獨(dú)資企業(yè)或合伙企業(yè)持有被投資企業(yè)的股權(quán)，在轉(zhuǎn)讓持有的被投資企業(yè)的股權(quán)時(shí)，就股權(quán)增值而產(chǎn)生的溢價(jià)金額，一律按照5%~35%的稅率計(jì)算繳納個(gè)人所得稅，不再按照0.5%~3.5%的稅收洼地的核定征收稅率繳納個(gè)人所得稅。如此，在2021年最后一天，財(cái)政部和國家稅務(wù)總局聯(lián)手又堵住了一個(gè)個(gè)人所得稅的漏洞！

不過，注冊(cè)登記在稅收洼地的個(gè)人獨(dú)資企業(yè)或合伙企業(yè)，依然享有當(dāng)?shù)氐呢?cái)政返還的優(yōu)惠政策，如果因?yàn)檗D(zhuǎn)讓持有的被投資企業(yè)的股權(quán)而繳納了較高的個(gè)人所得稅，比如有的達(dá)到幾百萬元、幾千萬元甚至上億元，那么當(dāng)?shù)刎?cái)政返還的金額還是相當(dāng)可觀的！