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      【有機(jī)】Science后再發(fā)Nat. Chem.:17個(gè)結(jié)構(gòu)多樣性pleuromutilin類抗生素的全合成

       子孫滿堂康復(fù)師 2022-11-02 發(fā)布于黑龍江

      導(dǎo)讀:

      最近,美國耶魯大學(xué)(Yale University)Seth B. Herzon教授課題組報(bào)道了一種通用的全合成路線,能夠?qū)崿F(xiàn)17個(gè)結(jié)構(gòu)多樣性pleuromutilins類抗生素的高效合成。該全合成路線采取的關(guān)鍵反應(yīng)包括:1)以乙烯基Wolff重排為關(guān)鍵反應(yīng)構(gòu)建C9位季碳立體中心;2)以非對映選擇性丁炔基化構(gòu)建C14位二級醇羥基;3)以exo-選擇性鎳催化還原環(huán)化構(gòu)建8元環(huán)。作者還通過生物活性研究對構(gòu)效關(guān)系進(jìn)行了評估。相關(guān)研究成果發(fā)表在近期的《自然-化學(xué)》上(Nat. Chem. DOI: 10.1038/s41557-022-01027-7)。

      背景介紹(Fig. 1):

      耐藥性細(xì)菌病原體的快速出現(xiàn)使得新穎抗菌藥物的化學(xué)全合成顯得愈來愈重要。截短側(cè)耳素類抗生素pleuromutilin(1)是一種三環(huán)二萜類抗生素,是從Clitopilus屬擔(dān)子菌中分離出的真菌代謝產(chǎn)物(Fig. 1a)。研究顯示該二萜類化合物對革蘭氏陽性菌具有強(qiáng)效的抑制活性,且不易與其它蛋白質(zhì)合成抑制劑產(chǎn)生交叉耐藥性。Pleuromutilin類抗生素也存在缺陷,包括:1)口服利用度低;2)C8位易被細(xì)胞色素P450酶氧化而導(dǎo)致失活。因此,合成更多pleuromutilin類抗生素并進(jìn)行生物活性研究具有重要意義。

      瑞他帕林retapamulin(3)和來法莫林lefamulin(4)是兩個(gè)成功的pleuromutilin類抗生素臨床半合成新藥(Fig. 1a)。但是,相比研究廣泛的四環(huán)素類、大環(huán)內(nèi)酯類、鏈陽霉素類和林可酰胺類抗生素,pleuromutilin類抗生素的研究不夠深入。Sorensen組在2011年報(bào)道了多種重要的pleuromutilin類衍生物的制備,但這些衍生物只具有中等的生物活性(Chem. Sci. 2011, 2, 1258–1261)。耶魯大學(xué)Seth B. Herzon課題組曾在2017年報(bào)道了(+)-pleuromutilin(1)和12-epi-pleuromutilin(2)的全合成(Fig. 1b, Science 2017, 356, 956)。但該合成路線也存在局限性,包括:1)6參與的Nagata氫氰化反應(yīng)沒有普遍性;2)8和9的偶聯(lián)反應(yīng)底物普適性差;3)構(gòu)建好8元環(huán)后再構(gòu)建C14位季碳立體中心挑戰(zhàn)性極大;4)路線效率不高。為此,該課題組在最近報(bào)道了一種新的通用合成路線,能夠解決存在的這些問題。


      (Fig. 1,來源:Nat. Chem.)
      17個(gè)衍生物的全合成(Fig. 2-4):

      (圖1, 來源:Org. Lett. 2017, 18, 4980–4983)

      鑒于調(diào)整pleuromutilin(1)C12位基團(tuán)會對生物活性產(chǎn)生重要影響,且12去甲基衍生物具有和1相同的構(gòu)象(Fig. 2f),因此作者將12-去甲基衍生物作為合成目標(biāo)來簡化合成計(jì)劃。首先通過組內(nèi)已報(bào)道的合成路線規(guī)?;苽淦鹗荚?(圖1)。如Fig. 2a所示,6經(jīng)皂化反應(yīng)和重氮化反應(yīng)轉(zhuǎn)化成化合物11。11在Arndt–Eistert增碳反應(yīng)條件下反應(yīng),得到增碳產(chǎn)物12(47%)和乙烯基Wolff重排產(chǎn)物13(50%)。13可能是通過協(xié)同的[2,3]-重排或分子內(nèi)環(huán)丙烷化-碎片化反應(yīng)機(jī)理生成(Fig. 2b)。13經(jīng)立體選擇性氫氰化反應(yīng),高選擇性得到化合物18(d.r. > 20:1)。18經(jīng)乙二醇保護(hù)-立體選擇性甲基化高選擇性得到化合物19(d.r. > 20:1, X-ray)。碘甲烷是從(Z)-烯醇化物25中位阻較小的烯烴α-面進(jìn)攻(Fig. 2d)。19經(jīng)DIBAL-H還原酯基和氰基,得到化合物20。20經(jīng)篩選出的丁炔基化反應(yīng)條件(Table S1 in SI),以高產(chǎn)率和高選擇性得到化合物21(81%, d.r. = 37:1),構(gòu)建起C14位立體中心。該丁炔基化反應(yīng)是通過如圖2所示反應(yīng)機(jī)理,經(jīng)六元環(huán)過渡態(tài),在羰基位阻較小的α-面發(fā)生加成反應(yīng)。作者同時(shí)對該丁炔基化反應(yīng)進(jìn)行了底物拓展,高產(chǎn)率和高選擇性地得到8種C12位含不同炔基的衍生物27-34(Fig. 3a)。21經(jīng)IBX選擇性氧化一級醇羥基、exo-選擇性鎳催化還原環(huán)化反應(yīng)、引入乙醇酸片段22、脫去TES保護(hù)基4步反應(yīng)轉(zhuǎn)化成化合物23,構(gòu)建起8元環(huán)。23可以經(jīng)Crabtree加氫還原、磺酸酯置換、脫去乙二醇保護(hù)基,轉(zhuǎn)化成pleuromutilin的衍生物24(Fig. 2c)。24的絕對構(gòu)型可通過其酯水解產(chǎn)物26的X-單晶衍射分析確定(Fig. 2e)。23也可經(jīng)Crabtree加氫還原、和36發(fā)生磺酸酯置換、脫去Boc保護(hù)基轉(zhuǎn)化成lefamulin(4)的C12位去甲基化衍生物37(Fig. 3b)。至此,作者成功開發(fā)了一種新的通用合成路線,為后期開展骨架修飾pleuromutilin類衍生物合成奠定了基礎(chǔ)。


      (Fig. 2,來源:Nat. Chem.)
      (Tabel S1 in SI, 來源:Nat. Chem.)
      (圖2, 來源:Adv. Synth. Catal. 2009, 351, 2295–2300)
      (Fig. 3,來源:Nat. Chem.)

      Pleuromutilin類抗生素易發(fā)生C8位代謝氧化而失活,因此作者計(jì)劃對其核心骨架中6元環(huán)進(jìn)行結(jié)構(gòu)修飾,包括:1)6元環(huán)C7位加烷基取代基(Fig. 3c);2)6元環(huán)縮環(huán)至5元環(huán)或8元環(huán)縮環(huán)至7元環(huán)(Fig. 4),以阻礙C8位代謝氧化的發(fā)生。所修飾的骨架化合物再經(jīng)新開發(fā)的通用合成路線,可以高效轉(zhuǎn)化成難以通過半合成獲取的pleuromutilin骨架修飾類衍生物。

      如Fig. 3c所示,以(+)-pulegone為原料,經(jīng)3步反應(yīng)轉(zhuǎn)回為已知物38。38經(jīng)去飽和化反應(yīng)得到烯酮39,39經(jīng)硅促進(jìn)、銅催化的1,4-加成轉(zhuǎn)化成單一構(gòu)型產(chǎn)物40。40經(jīng)環(huán)丙烷化-氯化鐵促進(jìn)的擴(kuò)環(huán)反應(yīng)-加氫還原反應(yīng)得到化合物42。42經(jīng)如圖1所示的5元環(huán)合成方式,轉(zhuǎn)化成雙環(huán)烯酮化物43。以Fig. 2a-2b和Fig. 3b中開發(fā)出的通用合成路線為基礎(chǔ),43經(jīng)類似的15步反應(yīng)成功轉(zhuǎn)化成lefamulin的C7位甲基化衍生物45,詳細(xì)合成路線見Fig. S1 in SI。


      (Fig. S1 in SI,來源:Nat. Chem.)

      如Fig. 4a所示,化合物38經(jīng)格氏試劑加成-酸促進(jìn)的重排反應(yīng)得到化合物46。46經(jīng)通用合成路線中類似的14步反應(yīng)轉(zhuǎn)化成化合物49(Fig. S2-S3)。49可以經(jīng)還原-引入側(cè)鏈-酸脫保護(hù)基3步反應(yīng)轉(zhuǎn)化成(11R)衍生物51。49也可以先經(jīng)Mitsunobu反應(yīng)反轉(zhuǎn)C11位構(gòu)型,再經(jīng)3步反應(yīng)轉(zhuǎn)化成lefamulin的6元環(huán)縮環(huán)衍生物55和56。


      (Fig. 4,來源:Nat. Chem.)
      (Fig. S2 in SI,來源:Nat. Chem.)
      (Fig. S3 in SI,來源:Nat. Chem.)

      如Fig. 4b和Fig. S4所示,化合物20經(jīng)3步反應(yīng)得到化合物57。57經(jīng)鎳催化還原環(huán)化反應(yīng)轉(zhuǎn)化成化合物58。58經(jīng)6步通用合成反應(yīng)即可轉(zhuǎn)化成8元環(huán)縮環(huán)衍生物59。


      (Fig. S4 in SI,來源:Nat. Chem.)

      同時(shí),作者通過氨基化、三氮唑化、環(huán)氧化等反應(yīng)開展了后期結(jié)構(gòu)修飾,得到9個(gè)新的C12位結(jié)構(gòu)修飾衍生物63-71,詳細(xì)合成路線見Fig. S5-S7。

      (Fig. S5 in SI,來源:Nat. Chem.)
      (Fig. S6 in SI,來源:Nat. Chem.)
      (Fig. S7 in SI,來源:Nat. Chem.)

      生物活性研究(Fig. 5):

      最后,作者開展生物活性研究和構(gòu)效關(guān)系評估。研究的衍生物包括:lefamulin(4)、可以通過半合成得到的衍生物60-62、新合成的衍生物63-71、37、45、51、55、56、59、24、72。通過如Fig. 5所示生物活性研究,作者得出如下結(jié)論:1)C12位基團(tuán)為直立鍵會降低生物活性(66);2)改變8元環(huán)的構(gòu)象會影響細(xì)胞吸收或核糖體結(jié)合,使衍生物不具有生物活性(69-70);3)C7位甲基化衍生物45和縮環(huán)衍生物51、55、56、59也基本都無生物活性;4)不含極性側(cè)鏈的衍生物24也無活性,證明衍生物含有極性側(cè)鏈的重要性。


      (Fig. 5,來源:Nat. Chem.)

      總結(jié):

      總之,Seth B. Herzon教授課題組通過一種通用全合成路線,高效合成17個(gè)結(jié)構(gòu)多樣性pleuromutilins類抗生素,并通過生物活性研究確定構(gòu)效關(guān)系。作者后期將進(jìn)一步開展結(jié)構(gòu)修飾,以期解決長期存在的口服利用低和代謝穩(wěn)定性問題。

      論文信息:

      Total synthesis of structurally diverse pleuromutilin antibiotics

      Olivia Goethe, Mikaela DiBello and Seth B. Herzon*

      Nat. Chem. DOI: 10.1038/s41557-022-01027-7

      來源:CBG資訊


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