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      FLUKA 4-3.0和Flair 3.2-1安裝調試

       ProtonCN 2022-11-02 發(fā)布于北京

      FLUKA 4-3.0是CERN九月份發(fā)布的第三個主版本,我們比較關注的更新有:體素幾何中危及器官勾畫的上限個數(shù)從100提升至400;用戶自定義程序source_newgen.f 可以從能譜(能量、強度)文件中進行抽樣了;對程序的使用說明書做了比較大的重整。同時Flair也升級到3.2-1版本。
      Ubuntu 18.04安裝
      Ubuntu 18.04是穩(wěn)定版本,加上有前期安裝經(jīng)驗,穩(wěn)妥起見我們安裝Ubuntu 18.04,安裝Ubuntu的常規(guī)操作本文不再贅述。Ubuntu下載地址:https:///。我們在以前裝有FLUKA4.0的機器上進行測試安裝。

      FLUKA安裝

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      老版本


      如果是老系統(tǒng),里面安裝了原來版本的FLUKA,我們建議保留原來的版本,因為Flair可以獨立進行路徑修改,這方便了我們隨時可以選擇不同版本進行計算。

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      安裝包下載

      找到CERN提供的下載網(wǎng)頁:https://fluka.cern/download/latest-fluka-release,這一次我們選擇用于Linux的.deb版本,也就是第三個。deb版本的安裝相對最簡單。

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      gfortran安裝

      由于沿用之前的系統(tǒng)版本,無需安裝gfortran,有需要的讀者參照之前的報告FLUKA 4.0和Flair 3.1安裝調試報告》中關于gfortran安裝的章節(jié)。

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      FLUKA安裝

      把下載好的FLUKA安裝包復制到Ubuntu系統(tǒng)下的新建文件夾home/FLUKA4-3.0。文件夾命名可以隨意,但不能有空格。

      然后在終端上用命令sudo dpkg -i fluka_4-2.0.x86-Linux-gfor7_amd64.deb進行解壓和安裝。如果出現(xiàn)報錯,先執(zhí)行下面三行命令:
      sudo rm /var/lib/dpkg/lock
      sudo rm /var/lib/dpkg/lock-frontend
      sudo rm /var/cache/apt/archives/lock

      這個時候打開bin目錄查看發(fā)現(xiàn),已經(jīng)生成了可執(zhí)行文件fluka等,注意,這種deb格式安裝后跟tgz格式安裝的目錄不同,deb安裝在根目錄下面/usr/local/fluka/bin。


      Flair安裝

      Flair是FLUKA的GUI。由于其友好的用戶界面,推薦大家都安裝使用,CERN版本的FLUKA則是強制使用的。目前最新版本是flair 3.2-1。對于Ubuntu系統(tǒng),優(yōu)先采用repository庫安裝方法。

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      repository庫安裝Flair

      相比于之前復雜的安裝過程,尤其是依賴包的安裝過程,CERN提供了一個打包好的簡易安裝方式,也就是常用的repository。用這種方法只需要三步就能完成flair和flair-geoviewer及其他依賴包的安裝。

      (1)安裝repository庫的key,安裝公共存儲庫密鑰命令行是:
      sudo wget -q -O - https://flair.web./flair/download/ubuntu/flair.gpg | sudo apt-key add -

      (2)安裝Ubuntu 18.04對應的repository庫,命令行是:

      sudoadd-apt-repository'deb [arch=all,amd64]https:///flair/download/ubuntu/18.04 /'

      這一步可能需要時間比較長,根據(jù)當?shù)氐木W(wǎng)速而定,可以喝杯咖啡休息一下。如果發(fā)現(xiàn)第三步無法進行,需要重復一下這一步。


      (3)輸入安裝命令回車:sudo apt install flair。在終端中可以看到許多依賴包,包括DICOM相關的模塊都將自動安裝。這步的時間較長,根據(jù)當?shù)氐木W(wǎng)速而定。如果不成功,嘗試換個時間段。

      可以看到flair成功升級到3.2-1版本:


      Flair運行測試

      用命令行打開flair:flair sobp.inp &。新版Flair打開后彈出證書協(xié)議,拉到最底部點擊I agree即可。

      點擊菜單上的Updates控件檢查版本情況,發(fā)現(xiàn)FLUKA(9月15日發(fā)布)和Flair(10月24日發(fā)布)的版本都已經(jīng)是最新的了。

      如果出現(xiàn)無法識別FLUKA unkown的情況, 并且要求set fluka directory:

      這里就需要最后做一個簡單的手動操作:進入Flair的配置界面Config,將安裝路徑/usr/local/fluka/bin復制到Fluka Directory中,其他不變。設置好之后點擊OK。

      對于啟用Source的讀者,Source的編譯請參照之前的文章《FLUKA進階——展寬的布拉格峰》。中源文件一節(jié),最初編譯自定義用戶文件時可能遇到這樣的錯:

      是因為缺少libz-dev,我們用命令安裝:sudo apt install libz-dev

      這時候就可以正常編譯了:

      設置50,000粒子數(shù),再進入運行Run界面,點擊Start。運行1個cycle,需要不到1 min。

      運行完成后,再合并fort文件得到.bnn文件就可以畫圖了。進入Plot界面畫二維圖,其操作過程跟原來版本一致,得到SOBP,并與質子能量的權重合成一個圖,如下所示。

      (質子中國 編輯報道)

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      FLUKA進階——展寬的布拉格峰
      FLUKA入門——你的第一個質子布拉格峰
      CERN新版FLUKA程序安裝調試報告
      FLUKA-CERN新版安裝調試報告
      FLUKA 4.0和Flair 3.1安裝調試報告
      FLUKA 4-2.0和Flair 3.1-15.1安裝調試
      FLUKA 4-1.1和FLAIR 3.1-13安裝調試報告
      FLUKA實操——DICOM數(shù)據(jù)導入及Voxel生成
      FLUKA實操——質子治療瞬發(fā)輻射劑量計算
      FLUKA高級應用——質子在磁場中的運動
      FLUKA高級應用——質子治療系統(tǒng)的輻射防護
      FLUKA高級應用——病人QA中的MC劑量驗證計算
      FLUKA擴展——SimpleGEO建模與數(shù)據(jù)可視化處理
      FLUKA綜述:粒子治療多功能技術仿真實驗室
      多用途蒙卡程序FLUKA新功能及未來展望

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