宮頸癌(CC)是婦科第三大常見癌癥和第四大致死原因，但其確切進(jìn)展尚不明確，主要是由于腫瘤發(fā)生的不同階段腫瘤微環(huán)境變化的高度復(fù)雜性所致。重要的是，缺乏對CC患者不同階段腫瘤微環(huán)境(TME)的詳細(xì)比較單核轉(zhuǎn)錄分析。

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近日，來自佛山市第一人民醫(yī)院的研究者們在J Exp Clin Cancer Res雜志上發(fā)表了題為“Single-nucleus RNA sequencing and deep tissue proteomics reveal distinct tumour microenvironment in stage-I and II cervical cancer”的文章，該研究為破譯CC的進(jìn)展提供了重要的資源，并為開發(fā)診斷CC和治療免疫抑制的TME的新方法奠定了基礎(chǔ)。

在這項研究中，從I期和II期CC患者的腫瘤組織中提取了42,928和29,200個核，并進(jìn)行了單核RNA測序(SnRNA-seq)分析。利用生物信息學(xué)工具對細(xì)胞異質(zhì)性和功能進(jìn)行比較研究。此外，還進(jìn)行了基于無標(biāo)記定量質(zhì)譜學(xué)的蛋白質(zhì)組學(xué)分析。比較I期和II期CC患者的蛋白質(zhì)組圖譜，并與SnRNA-seq進(jìn)行整合分析。

與I期CC(CCI)患者相比，II期CC(CCII)患者多種免疫細(xì)胞中與免疫反應(yīng)相關(guān)的信號通路受到抑制，但與細(xì)胞和組織發(fā)育相關(guān)的信號豐富，線粒體相關(guān)基因上調(diào)提示代謝產(chǎn)生能量。這與定量蛋白質(zhì)組學(xué)分析顯示CCII組TME中促進(jìn)細(xì)胞生長和細(xì)胞間基質(zhì)發(fā)育的蛋白質(zhì)占主導(dǎo)地位是一致的。

在腦梗塞患者的許多細(xì)胞群體中，干擾素-α和γ反應(yīng)出現(xiàn)了最活躍的通路。在CCII組中發(fā)現(xiàn)COL12A1、COL5A1、COL4A1和COL4A2等幾種膠原蛋白顯著上調(diào)，提示它們在診斷CC進(jìn)展中的作用。一個新的轉(zhuǎn)錄本AC244205.1被檢測到是CCII患者中最上調(diào)的基因，其在CC中的可能機(jī)制可能被進(jìn)一步研究。

CCI患者TME中腫瘤相關(guān)干細(xì)胞(TASCs)和上皮細(xì)胞的免疫反應(yīng)更為活躍

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在這項研究中，我們用SnRNA-seq和無標(biāo)記定量蛋白質(zhì)組學(xué)方法比較研究了I期和II期CC患者的TME。結(jié)果表明，II期CC患者幾乎所有免疫細(xì)胞，包括MΦs、T細(xì)胞、B細(xì)胞、NK細(xì)胞和樹突狀細(xì)胞的異質(zhì)性受到很大程度的調(diào)節(jié)，其表型具有明顯的免疫抑制作用。相比之下，這些細(xì)胞在I期CC患者中表現(xiàn)出高免疫反應(yīng)，其中干擾素-α和γ反應(yīng)是最活躍的信號通路。幾個組蛋白顯示了在早期診斷CC的潛力。

值得注意的是，對于II期CC患者，多種細(xì)胞類型的SnRNA-seq分析和蛋白質(zhì)組分析分別鑒定出膠原蛋白的顯著上調(diào)，提示它們可能作為預(yù)后標(biāo)志物。首次揭示了新轉(zhuǎn)錄本AC244205.1的異常表達(dá)與II期CC的相關(guān)性。這些發(fā)現(xiàn)為CC的臨床診斷和免疫治療提供了重要線索，值得進(jìn)一步研究。（生物谷 Bioon.com）

參考文獻(xiàn)

Xiaosong Liu et al. Single-nucleus RNA sequencing and deep tissue proteomics reveal distinct tumour microenvironment in stage-I and II cervical cancer. J Exp Clin Cancer Res. 2023 Jan 23;42(1):28. doi: 10.1186/s13046-023-02598-0.