作為細(xì)胞的結(jié)構(gòu)基礎(chǔ)和實(shí)際的功能執(zhí)行者，蛋白質(zhì)可以提供一些DNA和RNA不能提供的信息。1994年，澳大利亞科學(xué)家Marc Wilkins率先提出了蛋白質(zhì)組（Proteome）這一概念，即一個(gè)細(xì)胞、組織或有機(jī)體所表達(dá)的全部蛋白質(zhì)。蛋白質(zhì)組學(xué)（Proteomics）則用于鑒定出某一研究對象的全部蛋白，目的是從整體的角度分析其蛋白質(zhì)組成成分、表達(dá)水平與修飾狀態(tài)，了解蛋白質(zhì)之間的相互作用與聯(lián)系，揭示蛋白質(zhì)功能與細(xì)胞生命活動(dòng)的規(guī)律。

近年來，隨著蛋白質(zhì)的分離、質(zhì)譜鑒定及生物信息學(xué)分析等技術(shù)的發(fā)展，蛋白質(zhì)組學(xué)漸漸為腫瘤生物學(xué)研究打開了一個(gè)新的窗口。如今，在腫瘤蛋白標(biāo)志物的篩選、腫瘤發(fā)生機(jī)制的研究、腫瘤的治療評價(jià)等方面，蛋白質(zhì)組學(xué)已成為不可或缺的工具。

蛋白質(zhì)組學(xué)可用于鑒定腫瘤早期檢測、診斷、預(yù)后及療效預(yù)測的標(biāo)志物。例如，用質(zhì)譜法檢測發(fā)現(xiàn)，與無瘤對照組相比，直徑小于2厘米的肝細(xì)胞癌患者的血清波形蛋白明顯過表達(dá)，預(yù)示波形蛋白單獨(dú)或與甲胎蛋白（AFP）聯(lián)合，可作為檢測體積較小的肝癌的標(biāo)志物，或?qū)⑹垢喔伟┰谠缙诰捅话l(fā)現(xiàn)。

美國食品藥品管理局（FDA）于2009年批準(zhǔn)了一種基于蛋白質(zhì)組學(xué)的檢測方法，可以幫助醫(yī)生在手術(shù)或活檢之前，確定患有附件腫塊的女性患卵巢癌的風(fēng)險(xiǎn)，該血液檢測使用的標(biāo)志物是：轉(zhuǎn)甲狀腺素蛋白（TT）、載脂蛋白A1（APOA1）、β2-微球蛋白（β2M）、轉(zhuǎn)鐵蛋白（TFR）和癌抗原125（CA125）。

對于非小細(xì)胞肺癌，通過檢測血清淀粉樣蛋白A（SAA）發(fā)現(xiàn)，與生存期大于5年的患者相比，生存期低于5年的患者，其SAA水平明顯增高，SAA可能成為預(yù)測非小細(xì)胞肺癌患者預(yù)后的非侵襲性標(biāo)志物。

今天介紹了蛋白質(zhì)組學(xué)及其鑒定癌癥生物標(biāo)志物的一些研究進(jìn)展，如今，越來越多的研究嘗試將蛋白質(zhì)組學(xué)和基因組學(xué)聯(lián)合分析，以求進(jìn)一步探明癌癥的發(fā)病機(jī)制、特異性標(biāo)志物及治療靶點(diǎn)，此類研究成果有望使更多癌癥患者獲得早期診斷與精準(zhǔn)治療。