人類基因組由大約22,000個蛋白質(zhì)編碼基因(PCG)組成，這些基因能夠通過選擇性剪接(AS)產(chǎn)生不止一個轉(zhuǎn)錄本?；蜣D(zhuǎn)錄產(chǎn)生一個可經(jīng)受各種剪接事件的前mRNA分子，由于許多基因中存在跳過的外顯子(SE)、選擇性的30個剪接點(A3SS)、選擇性的5'剪接點(A5SS)、互斥的外顯子(MXE)和內(nèi)含子保留(IR)，從而產(chǎn)生過多的剪接變異體。

因此，前信使核糖核酸分子可以顯著增加轉(zhuǎn)錄組的復雜性，從而擴大蛋白質(zhì)組的多樣性。在人類中，90%-95%的多外顯子基因產(chǎn)生選擇性剪接的RNA轉(zhuǎn)錄本，因此AS的廣泛使用強調(diào)了AS的重要性。

事實上，AS是一個高度動態(tài)的過程，影響細胞生物學的許多方面，因此對于在分化和發(fā)育過程中產(chǎn)生成年組織和組織身份至關(guān)重要。然而，PCG的外顯子組只占整個人類基因組的2%。

圖片來源：https:///10.1016/j.omtn.2023.03.004.

近日，來自加拿大的研究者們在Molecular Therapy: Nucleic Acids雜志上發(fā)表了題為“Distinct regulatory functions and biological roles of lncRNA splice variants”的綜述性文章，該研究總結(jié)了LncRNA剪接變異體的不同調(diào)控功能和生物學作用。

RNA分子的選擇性剪接(AS)是轉(zhuǎn)錄組多樣性的關(guān)鍵因素。在人類中，90%-95%的多外顯子基因產(chǎn)生選擇性剪接的RNA轉(zhuǎn)錄本。因此，每個基因都有機會產(chǎn)生多種剪接變體，包括經(jīng)過RNA成熟步驟(如常規(guī)剪接和選擇性剪接)的長非編碼RNA(LncRNA)基因。

新出現(xiàn)的證據(jù)表明，這些lncRNA剪接變異體在細胞生物學的許多方面發(fā)揮著重要作用。特定的lncRNA剪接變異體表達的不同變化也與包括癌癥在內(nèi)的許多疾病有關(guān)。這篇綜述涵蓋了關(guān)于這一新興調(diào)查主題的當前知識。

研究者對lncRNAs的AS景觀提供了獨家見解，并在分子水平上描述了lncRNA剪接變體的功能相關(guān)性，即基于RNA的差異功能、微肽的產(chǎn)生和環(huán)狀RNA的產(chǎn)生。最后，研究者討論了這一新興領(lǐng)域令人興奮的前景，并概述了進一步發(fā)展該領(lǐng)域研究努力所需的工作。

利用lncRNA剪接變異體生產(chǎn)微肽

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總之，除了其譜系的擴展外，lncRNA剪接變異體的功能鑒定是該領(lǐng)域未來幾年的一大挑戰(zhàn)。到目前為止，在功能水平上研究的lncRNA變體相對較少，它們的生物學意義仍然不清楚。然而，越來越多的證據(jù)表明，由于調(diào)控失調(diào)與癌癥的進展或疾病的發(fā)展密切相關(guān)，因此提供了有希望的和有價值的預后和診斷生物標記物。

開發(fā)新的治療方法(如ASOS)非常重要，因為lncRNA剪接變異體可能提供很強的臨床相關(guān)性。然而，在考慮任何治療應(yīng)用之前，促進我們對這些lncRNA剪接變體的功能作用的理解是至關(guān)重要的。（生物谷 Bioon.com）

參考文獻

Muhammad Riaz Khan et al. Distinct regulatory functions and biological roles of lncRNA splice variants. Mol Ther Nucleic Acids. 2023 Mar 15;32:127-143. doi: 10.1016/j.omtn.2023.03.004.