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      Cell Stem Cell:鄧宏魁綜述化學(xué)重編程調(diào)控細(xì)胞命運(yùn)的應(yīng)用和未來前景

       子孫滿堂康復(fù)師 2023-08-29 發(fā)布于黑龍江

      來源:生物世界 2023-08-28 14:29

      綜述了化學(xué)重編程技術(shù)的建立過程,總結(jié)了過去十年該技術(shù)在調(diào)控細(xì)胞命運(yùn)和功能上的應(yīng)用,展望了這一技術(shù)未來發(fā)展的前景。
      北京大學(xué)教授鄧宏魁等應(yīng)邀在 Cell Stem Cell 期刊發(fā)表魯題為:Chemical Reprogramming for Cell Fate Manipulation: Methods, Applications, and Perspectives 的觀點(diǎn)文章,綜述了化學(xué)重編程技術(shù)的建立過程,總結(jié)了過去十年該技術(shù)在調(diào)控細(xì)胞命運(yùn)和功能上的應(yīng)用,展望了這一技術(shù)未來發(fā)展的前景。
       

      多細(xì)胞生物個(gè)體發(fā)育的本質(zhì)是多種細(xì)胞譜系建立的過程,細(xì)胞在這一過程中面臨著一系列的命運(yùn)調(diào)控。細(xì)胞命運(yùn)調(diào)控的錯(cuò)誤會(huì)導(dǎo)致產(chǎn)生狀態(tài)、功能、類型異常的細(xì)胞,這也是多種重大疾病形成的重要原因。建立精準(zhǔn)調(diào)控細(xì)胞命運(yùn)的方法,是實(shí)現(xiàn)調(diào)控個(gè)體發(fā)育、生理、代謝和衰老等生命活動(dòng)以及疾病治療的基本途徑?;瘜W(xué)重編程技術(shù),即通過化學(xué)小分子調(diào)控細(xì)胞命運(yùn),為細(xì)胞命運(yùn)調(diào)控提供了精確、靈活、可控的手段,為治療重大疾病和再生醫(yī)學(xué)帶來了新的可能。

      長久以來,發(fā)育過程中細(xì)胞命運(yùn)決定被認(rèn)為是單向不可逆的,然而細(xì)胞重編程技術(shù)的建立打破了這一固有認(rèn)知,并開啟了干細(xì)胞和再生醫(yī)學(xué)研究的新時(shí)代(圖1)。上世紀(jì)60年代,英國發(fā)育生物學(xué)家 John Gurdon 通過“核移植”細(xì)胞重編程技術(shù),即利用去核的卵母細(xì)胞將體細(xì)胞逆轉(zhuǎn)到胚胎發(fā)育的初始狀態(tài),證明了發(fā)育過程的可逆性。2006年,日本科學(xué)家山中伸彌建立了誘導(dǎo)多能干細(xì)胞技術(shù)(iPS技術(shù)),采用轉(zhuǎn)基因過表達(dá)轉(zhuǎn)錄因子的方法將體細(xì)胞重編程至類似胚胎干細(xì)胞的多能狀態(tài)。這兩項(xiàng)工作證明了細(xì)胞固有的內(nèi)源物質(zhì)(卵母細(xì)胞質(zhì)和轉(zhuǎn)錄因子)可以逆轉(zhuǎn)細(xì)胞命運(yùn),并于2012年獲得諾貝爾生理學(xué)或醫(yī)學(xué)獎(jiǎng)。

      然而,核移植和iPS技術(shù)采用細(xì)胞內(nèi)源遺傳物質(zhì)進(jìn)行重編程,該方法涉及復(fù)雜的生物學(xué)反應(yīng),其過程和效應(yīng)難以控制,很難實(shí)現(xiàn)對(duì)細(xì)胞命運(yùn)的精準(zhǔn)調(diào)控。相比之下,化學(xué)小分子刺激(非遺傳性外源物質(zhì)),具有細(xì)胞膜穿透性強(qiáng)、有序調(diào)控性強(qiáng)、動(dòng)態(tài)可逆、非基因組整合、操作簡單等諸多優(yōu)勢(shì)?;瘜W(xué)小分子組合可實(shí)現(xiàn)對(duì)多個(gè)靶點(diǎn)和信號(hào)通路的同時(shí)調(diào)控,易于開發(fā)精準(zhǔn)調(diào)控細(xì)胞命運(yùn)的新策略。由于生命的本質(zhì)是化學(xué)過程,通過化學(xué)小分子調(diào)控細(xì)胞命運(yùn),理論上是最有效的方式。

      圖1:細(xì)胞命運(yùn)重編程技術(shù)
      2013年,北京大學(xué)鄧宏魁團(tuán)隊(duì)在 Science 期刊發(fā)表了題為:Pluripotent stem cells induced from mouse somatic cells by small-molecule compounds 的論文【2】,首次報(bào)道僅使用化學(xué)小分子將發(fā)育成熟的體細(xì)胞重編程到多能干細(xì)胞(chemically induced pluripotent stem cell,CiPS細(xì)胞),建立了細(xì)胞命運(yùn)調(diào)控的化學(xué)重編程技術(shù),開辟了全新的細(xì)胞命運(yùn)調(diào)控途徑(圖1)。
      2022年,鄧宏魁團(tuán)隊(duì)又率先在 Nature 期刊上報(bào)道了人體細(xì)胞化學(xué)重編程的工作【3】,成功地應(yīng)用化學(xué)小分子誘導(dǎo)人的體細(xì)胞去分化,并獲得人多能干細(xì)胞,為研究人體細(xì)胞命運(yùn)調(diào)控和干細(xì)胞制備與轉(zhuǎn)化提供了新范式。
       
      與核移植和轉(zhuǎn)錄因子過表達(dá)調(diào)控的方法相比,化學(xué)重編程在精準(zhǔn)調(diào)控細(xì)胞命運(yùn)方面具有顯著優(yōu)勢(shì)。首先,化學(xué)小分子可以通過組合的方式對(duì)多個(gè)靶點(diǎn)和通路同時(shí)調(diào)控,并且可以通過調(diào)整小分子的濃度和作用時(shí)間實(shí)現(xiàn)有序的精準(zhǔn)細(xì)胞重編程。機(jī)制研究進(jìn)一步表明,化學(xué)重編程是一個(gè)分階段、有序調(diào)控的過程。在誘導(dǎo)人CiPS細(xì)胞的過程中,細(xì)胞首先被誘導(dǎo)至類似低等動(dòng)物斷肢再生(regeneration-like)的中間態(tài),再被誘導(dǎo)至類胚外內(nèi)胚層(XEN-like)的中間態(tài),最終達(dá)到并穩(wěn)定在多能狀態(tài)(圖2)。這一過程呈現(xiàn)出分步、逆向發(fā)育的特點(diǎn),與低等動(dòng)物再生過程相似:體細(xì)胞響應(yīng)外源損傷信號(hào)刺激后去分化,產(chǎn)生介導(dǎo)組織再生的中間態(tài)細(xì)胞。因此,化學(xué)重編程是一種更近于自然過程的細(xì)胞命運(yùn)調(diào)控方式。

      圖2:化學(xué)重編程誘導(dǎo)人多能干細(xì)胞

      目前,化學(xué)小分子調(diào)控細(xì)胞命運(yùn)已被廣泛應(yīng)用于干細(xì)胞與再生醫(yī)學(xué)研究(圖3)。利用化學(xué)小分子可以實(shí)現(xiàn)譜系重編程,在體外將成纖維細(xì)胞轉(zhuǎn)分化為神經(jīng)元、心肌細(xì)胞和肝臟細(xì)胞等。更重要的是,化學(xué)重編程可以在體內(nèi)實(shí)現(xiàn)原位誘導(dǎo)星形膠質(zhì)細(xì)胞轉(zhuǎn)化為神經(jīng)元,誘導(dǎo)成纖維細(xì)胞轉(zhuǎn)化為心肌細(xì)胞等,為體內(nèi)組織器官原位再生提供了新的手段。利用化學(xué)小分子可以捕獲不同發(fā)育階段的干細(xì)胞類型,建立了原始態(tài)(Na?ve)多能干細(xì)胞、潛能拓展的多能干細(xì)胞(EPS)培養(yǎng)體系,并在體外建立全能干細(xì)胞方面取得了重要進(jìn)展。此外,利用化學(xué)小分子還可以實(shí)現(xiàn)原代肝臟細(xì)胞、造血干細(xì)胞和腸道類器官等功能細(xì)胞在體外的長期維持。這些進(jìn)展充分展現(xiàn)了化學(xué)小分子在精準(zhǔn)調(diào)控細(xì)胞命運(yùn)方面的優(yōu)勢(shì)。

      圖3:化學(xué)重編程在細(xì)胞命運(yùn)調(diào)控方面的拓展應(yīng)用

      展望未來,化學(xué)重編程有望為實(shí)現(xiàn)組織器官再生和對(duì)抗衰老等重大問題提供新的解決方案。通過在小鼠玻璃體腔中注射化學(xué)小分子,初步實(shí)現(xiàn)了體內(nèi)誘導(dǎo)視神經(jīng)再生。此外,在體細(xì)胞重編程至多能性狀態(tài)的過程中,衰老相關(guān)的表觀遺傳標(biāo)記會(huì)被擦除。利用化學(xué)重編程可以將來自老年個(gè)體的體細(xì)胞重編程為多能干細(xì)胞,表明使用化學(xué)小分子逆轉(zhuǎn)衰老相關(guān)的表觀遺傳標(biāo)記的可能性。這些工作展現(xiàn)出化學(xué)重編程在促進(jìn)再生和對(duì)抗衰老方面的潛力。未來結(jié)合多組學(xué)、深度學(xué)習(xí)和人工智能等新技術(shù),將進(jìn)一步加速化學(xué)重編程技術(shù)在精準(zhǔn)調(diào)控細(xì)胞命運(yùn)方面的應(yīng)用,為解決機(jī)體再生和衰老等問題提供新的可能(圖4)。

      圖4:化學(xué)重編程技術(shù)的未來發(fā)展方向
      北京大學(xué)鄧宏魁教授、昌平實(shí)驗(yàn)室孫仕成博士為該文章通訊作者,北京大學(xué)第三醫(yī)院王金琳副研究員為該文章第一作者。該工作獲得了國家自然科學(xué)基金基礎(chǔ)科學(xué)中心項(xiàng)目“化學(xué)重編程調(diào)控細(xì)胞可塑性”的支持。
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