  耶氏肺孢子菌肺炎  Chapter 01 疾病簡(jiǎn)介 耶氏肺孢子菌肺炎(Pneumocystis Jiroveci Pneumonia, PJP)，是由耶氏肺孢子菌引起的一種真菌感染性疾病，是臨床艾滋病(HIV)患者中最常見的疾病，也是免疫缺陷病患者死亡的重要原因之一。 一般來說，耶氏肺孢子菌為條件致病菌，免疫力正常的人群幾乎不會(huì)感染肺孢子菌，只有免疫缺陷時(shí)才會(huì)被感染，從而表現(xiàn)出一系列癥狀。 臨床表現(xiàn)：耶氏肺孢子菌肺炎多為突然的發(fā)熱、咳嗽及呼吸困難，逐漸加重，可伴有其他非特異性的癥狀，如乏力、腹瀉、消瘦等。影像學(xué)雙肺呈彌漫性網(wǎng)狀、小結(jié)節(jié)間質(zhì)性浸潤(rùn)征象，但需注意的是10%~39% 的早期患者胸片會(huì)表現(xiàn)為正?；蚪咏！?/span>   圖片來源于騰訊醫(yī)典 易感人群：耶氏肺孢子菌在兒童、孕婦、無基礎(chǔ)免疫抑制人群(低載量)、慢性疾病患者中定植，易感人群主要分為兩類，一類為HIV患者(CD4+T細(xì)胞計(jì)數(shù)≤ 200/μl)，另一類為非HIV感染免疫力低下患者，其中包括實(shí)體瘤或血液系統(tǒng)惡性腫瘤患者；免疫抑制治療患者；器官移植受者；CMV感染患者等。 檢測(cè)方法：包括血液學(xué)檢查、血清學(xué)檢查、動(dòng)脈血?dú)夥治龊头喂δ堋⒉≡瓕W(xué)檢查和胸部CT檢查等。但耶氏肺孢子菌分滋養(yǎng)體和包囊，包囊靠空氣傳播，繁殖緩慢，臨床上很難培養(yǎng)，陽性率較低，也不能直接精準(zhǔn)定位到致病病原體。 因此，基于宏基因組測(cè)序(mNGS)和多重靶向測(cè)序(tNGS)的多種優(yōu)點(diǎn)，這兩種測(cè)序技術(shù)在臨床應(yīng)用也越來越廣泛。 治療方法：以“復(fù)方磺胺甲惡唑片”為基礎(chǔ)用藥，可聯(lián)合使用其他抗真菌藥物。對(duì)重癥患者推薦使用激素，必要時(shí)需應(yīng)用呼吸機(jī)輔助治療。 但該病發(fā)病率高，恢復(fù)性差，非HIV感染人群恢復(fù)性更差，目前臨床工作主要以預(yù)防為主。 預(yù)防措施： （1）注意免疫抑制者與患者的隔離，防止交叉感染。 （2）對(duì)高危人群應(yīng)密切注意觀察。 （3）對(duì)有發(fā)生耶氏孢子蟲感染危險(xiǎn)的病人，應(yīng)用藥物預(yù)防，可有效地防止?jié)撛诟腥巨D(zhuǎn)變?yōu)榕R床疾病和治療后復(fù)發(fā)。 Chapter 02 美格醫(yī)學(xué)病例報(bào)告 1、黃XX：男，25歲。 臨床癥狀：發(fā)熱、咳嗽，血氧下降，已經(jīng)上呼吸機(jī)。 臨床確診：急性淋巴細(xì)胞性白血病 9 月余，急性淋巴細(xì)胞白血病骨髓移植術(shù)后半年。 mNGS檢測(cè)前用藥：亞胺培南西司他丁鈉、米卡芬凈鈉、更昔洛韋。 2021年10月18日，mNGS送檢，患者樣本類型為肺泡灌洗液，檢測(cè)結(jié)果符合臨床預(yù)期。 mNGS檢測(cè)結(jié)果如下圖：   2、楊XX：女，45歲。 臨床癥狀：咳嗽。 臨床初步診斷：結(jié)合臨床檢測(cè)，提示肺部感染，雙肺彌漫，腎移植狀態(tài)，重點(diǎn)懷疑耶氏肺孢子菌感染。 2021年10月19日，mNGS和tNGS送檢，患者樣本類型為肺泡灌洗液。檢測(cè)結(jié)果符合臨床預(yù)期，后轉(zhuǎn)用復(fù)方磺胺甲惡唑片，有好轉(zhuǎn)。 mNGS檢測(cè)結(jié)果如下圖：   tNGS檢測(cè)結(jié)果如下圖：  3、余X：男，29歲。 臨床癥狀：發(fā)熱、氣促。 臨床初步診斷：結(jié)合臨床檢測(cè)，提示肺部感染，懷疑急性淋巴細(xì)胞性白血病。 mNGS檢測(cè)前用藥：哌拉西林他唑巴坦。 2021年10月20日，mNGS和tNGS送檢，患者樣本類型為肺泡灌洗液。檢測(cè)結(jié)果符合臨床預(yù)期，轉(zhuǎn)用抗真菌藥，好轉(zhuǎn)，已痊愈出院。 mNGS檢測(cè)結(jié)果如下圖： tNGS檢測(cè)結(jié)果如下圖： Chapter 03 美格醫(yī)學(xué)mNGS和tNGS簡(jiǎn)介 美格醫(yī)學(xué)mNGS： 美格醫(yī)學(xué)mNGS不依賴于傳統(tǒng)的微生物培養(yǎng)，無需預(yù)設(shè)，直接對(duì)臨床樣本中的核酸進(jìn)行高通量測(cè)序，數(shù)據(jù)庫約有60萬+株微生物參考基因組，可精確鑒定到的微生物種類就達(dá)23796種。 采用Illumina Nextseq 550儀器測(cè)定，耗時(shí)短，數(shù)據(jù)質(zhì)量高，Q30＞90%，且具有個(gè)性化核酸提取方案，DNA、RNA病原雙流程檢測(cè)，可常溫保存和運(yùn)輸等優(yōu)點(diǎn)，可為臨床精準(zhǔn)定位致病病原體提供很大的便利。 美格醫(yī)學(xué)tNGS： 美格醫(yī)學(xué)tNGS是基于超多重PCR和二代測(cè)序技術(shù)的新型病原微生物檢測(cè)方法，包括有基礎(chǔ)版、升級(jí)版、高級(jí)版和分枝桿菌版四個(gè)版本的特定病原體檢測(cè)。 tNGS對(duì)比于mNGS，tNGS解決了mNGS受人源基因組及背景菌基因組干擾的問題、解決了mNGS對(duì)結(jié)核、真菌、胞內(nèi)菌等檢出率低的問題、解決了mNGS對(duì)RNA病毒檢測(cè)難度大的問題、并且能同時(shí)對(duì)特定物種的耐藥基因及毒力因子基因進(jìn)行分析。 |
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