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      Nature子刊:馮建峰團(tuán)隊等利用智能算法定義三種抑郁癥生物亞型

       子孫滿堂康復(fù)師 2023-10-25 發(fā)布于黑龍江

      來源:生物世界 2023-10-25 14:24

      該研究項目的主要負(fù)責(zé)人馮建峰教授表示:抑郁癥的臨床診斷和治療通常表現(xiàn)出較大的異質(zhì)性。我們的研究表明抑郁癥確實(shí)存在不同的腦結(jié)構(gòu)萎縮軌跡、差異的臨床癥狀和遺傳表達(dá)基礎(chǔ)。

      復(fù)旦大學(xué)類腦智能科學(xué)與技術(shù)研究院馮建峰教授、程煒研究員、賈天野研究員團(tuán)隊與中南大學(xué)湘雅二醫(yī)院等合作,在 Nature 子刊 Nature Mental Health 上發(fā)表了題為:Neurophysiological stratification of major depressive disorder by distinct trajectories 的研究論文。

      該研究基于大規(guī)模腦結(jié)構(gòu)影像數(shù)據(jù),利用數(shù)據(jù)驅(qū)動的智能算法,揭示了抑郁癥的大腦結(jié)構(gòu)縱向發(fā)展軌跡,精準(zhǔn)定位了抑郁癥大腦萎縮的三種起源,同時探究了這三種抑郁癥亞型的臨床癥狀和遺傳表達(dá)差異。

       

       

      基于張江抑郁癥隊列ZIB-MDD project、國內(nèi)大型抑郁癥隊列REST-meta-MDD project和國際隊列DecNef Project的腦結(jié)構(gòu)影像數(shù)據(jù),該團(tuán)隊采利用基于貝葉斯理論的疾病進(jìn)展模型來計算抑郁癥病人大腦灰質(zhì)萎縮軌跡與疾病亞型。該算法模型的優(yōu)勢在于,它可以基于橫截面的腦結(jié)構(gòu)影像數(shù)據(jù)估計灰質(zhì)萎縮的發(fā)展和演變過程,從而實(shí)現(xiàn)對疾病縱向演變的模擬??紤]到抑郁癥的發(fā)展是一個大腦萎縮和疾病癥狀不斷演變的過程,該研究從大量腦結(jié)構(gòu)影像的橫截面數(shù)據(jù)中推導(dǎo)出抑郁癥的發(fā)展進(jìn)程,以在疾病進(jìn)展的差異中識別抑郁癥亞型。
       
      圖1:課題研究思路
      通過對抑郁癥大腦萎縮發(fā)展軌跡和個體差異的分析,該研究推斷出三種不同但穩(wěn)定的抑郁癥腦萎縮軌跡(圖2),起始點(diǎn)分別位于前扣帶回皮層(anterior cingulate cortex)、海馬區(qū)域(hippocampus)和額上回(superior frontal gyrus)。

      在軌跡1中,大腦灰質(zhì)的萎縮首先出現(xiàn)在膝下前扣帶皮層(subgenual anterior cingulate cortex),然后擴(kuò)展到整個前扣帶回皮層(anterior cingulate cortex)。在軌跡2中,灰質(zhì)的萎縮首先出現(xiàn)在海馬區(qū)域(hippocampus),然后擴(kuò)展到顳葉(temporal regions)等區(qū)域。在軌跡3中,灰質(zhì)的萎縮首先出現(xiàn)在額上回(superior frontal gyrus),然后擴(kuò)展到整個眶額葉皮層(orbitofrontal cortex)。
       
      圖2:基于大腦結(jié)構(gòu)萎縮軌跡的抑郁癥三種亞型
      該研究在多個抑郁癥數(shù)據(jù)集中(張江抑郁癥隊列ZIB-MDD project和國際隊列DecNef Project)驗(yàn)證了抑郁癥的這三種萎縮軌跡(圖3),從而確定了基于大腦灰質(zhì)萎縮進(jìn)展的三種抑郁癥亞型的魯棒性。該研究通過比較驗(yàn)證數(shù)據(jù)集和發(fā)現(xiàn)數(shù)據(jù)集之間的萎縮軌跡(即亞型中腦區(qū)出現(xiàn)萎縮的先后順序)的相似性,確認(rèn)了在多個隊列中都存在的三種穩(wěn)定抑郁癥生物亞型。
       
      圖3:三種抑郁癥大腦萎縮軌跡的驗(yàn)證
      通過基于神經(jīng)影像確定的三種抑郁癥亞型,展現(xiàn)出了不同的臨床癥狀(圖4)。抑郁癥亞型1(ACC-led)表現(xiàn)出較高的自殺風(fēng)險;亞型2(hippocampus-led)表現(xiàn)出較高的軀體焦慮癥狀;亞型3(frontal-led)表現(xiàn)出較多的對生活和工作興趣缺失的問題。每一種抑郁癥亞型的腦萎縮和臨床癥狀之間的關(guān)聯(lián)展示了差異性的大腦模式,進(jìn)一步證實(shí)了抑郁癥亞型的存在性。
       
      圖4:抑郁癥亞型的臨床癥狀差異

      最后,基于美國艾倫腦科學(xué)研究所的人類基因表達(dá)譜公開數(shù)據(jù)庫Allen brain project,該研究揭示了抑郁癥不同亞型的潛在分子機(jī)制(圖5)。首先,該研究應(yīng)用偏最小二乘回歸和置換檢驗(yàn)估計了整體的解釋度,然后對每個亞型對應(yīng)的顯著基因進(jìn)行功能富集分析,從而確定了抑郁癥亞型不同的功能通路。另外,三種抑郁癥亞型分別表現(xiàn)出與過去研究發(fā)現(xiàn)的12個抑郁癥基因的不同關(guān)聯(lián),進(jìn)一步闡明了亞型之間存在差異性的遺傳表達(dá)基礎(chǔ)。

       

      圖5:抑郁癥亞型的遺傳表達(dá)差異

       

      考慮到抑郁癥的高度異質(zhì)性,基于客觀生物學(xué)指標(biāo)如大腦灰質(zhì)萎縮的分型對于臨床診治具有重要意義。抑郁癥亞型的腦結(jié)構(gòu)差異可以為病理變化提供生物學(xué)解釋,有望為抑郁癥的精準(zhǔn)診療提供可靠的生物學(xué)指標(biāo)。該研究利用數(shù)千例腦結(jié)構(gòu)影像數(shù)據(jù),首次定義了三種不同的腦萎縮軌跡的抑郁癥亞型,伴隨著不同的臨床癥狀和遺傳表達(dá)基礎(chǔ),為后續(xù)抑郁癥的自殺風(fēng)險預(yù)警和個體化精準(zhǔn)治療提供了新的思路。

       

      該研究項目的主要負(fù)責(zé)人馮建峰教授表示:抑郁癥的臨床診斷和治療通常表現(xiàn)出較大的異質(zhì)性。我們的研究表明抑郁癥確實(shí)存在不同的腦結(jié)構(gòu)萎縮軌跡、差異的臨床癥狀和遺傳表達(dá)基礎(chǔ)。我們希望這些發(fā)現(xiàn)可以為未來抑郁癥的個體化診療提供有效的參考依據(jù)。

       

      復(fù)旦大學(xué)類腦智能科學(xué)與技術(shù)研究院的博士后陳笛為論文第一作者,中南大學(xué)湘雅二醫(yī)院王湘教授、復(fù)旦大學(xué)類腦智能科學(xué)與技術(shù)研究院的Valerie Voon特聘研究員為論文共同第一作者。復(fù)旦大學(xué)類腦智能科學(xué)與技術(shù)研究院馮建峰教授、程煒研究員、賈天野研究員為論文共同通訊作者。

       

      該研究得到了科技創(chuàng)新2030-“腦科學(xué)與類腦研究”重大項目、國家重點(diǎn)研發(fā)計劃、上海市“腦與類腦智能基礎(chǔ)轉(zhuǎn)化應(yīng)用研究”市級科技重大專項、國家自然科學(xué)基金等的經(jīng)費(fèi)支持。該研究得到了張江抑郁癥隊列ZIB-MDD project、國內(nèi)大型抑郁癥隊列REST-meta-MDD project (DIRECT Consortium)、國際跨疾病隊列DecNef Project、中南大學(xué)湘雅二醫(yī)院和人類腦圖譜計劃Allen brain project等的大力支持和幫助。


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