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      ImageJ | 實(shí)錘Nature文章學(xué)術(shù)造假,已撤稿

       新用戶06711368 2024-07-11 發(fā)布于安徽

      科 / 研 / 圖 / 像 / 處 / 理

      圖片造假是學(xué)術(shù)造假的重災(zāi)區(qū),例如一圖多用、圖像裁剪拼接、圖像局部篡改等等。

      以 PS 替代真正的實(shí)驗(yàn),這種低成本的造假收益高,而且被發(fā)現(xiàn)的概率較低。國(guó)內(nèi)外的例子數(shù)不勝數(shù)。

      概率低,不代表不會(huì)被發(fā)現(xiàn),這篇文章會(huì)以小保方晴子 2014 年發(fā)的兩篇 Nature paper 為例,利用 ImageJ 實(shí)錘這兩篇文章中的學(xué)術(shù)造假。

      2014年1月29日,小保方晴子(Haruko Obokata)以第一作者的身份,在Nature 上發(fā)表了一篇 Article 和一篇 Letter,宣稱其發(fā)現(xiàn)了刺激觸發(fā)采集多功能(Stimulus Triggered Acquisition of Pluripotency)細(xì)胞,即 STAP細(xì)胞 [1][2]:

      圖片

      與 iPS 細(xì)胞相比,這種細(xì)胞的生成過(guò)程極為簡(jiǎn)單。STAP 細(xì)胞不需要導(dǎo)入外源 DNA,只需要給予外界刺激,例如酸性溶液浸泡,就可以獲得:

      圖片

      STAP cell-derived embryo (E10.5) from 4N blastocyst injection

      PubPeer 上很快就出現(xiàn)需要對(duì)這篇文章的質(zhì)疑,而且許多實(shí)驗(yàn)室 無(wú)法重復(fù)文章結(jié)果,最終兩篇文章都被撤稿 [3][4]。

      其中主要對(duì)兩篇文章的兩處 Figure 提出了質(zhì)疑:

      (1)Article 中的 Figure 1i 的電泳圖:

      圖片

      (2)Letter 中的 Figure1b 和 Figure 2g

      圖片

      其實(shí)用肉眼并不能很好地分辨哪里有問(wèn)題,但其實(shí) 肉眼觀察到的圖像信息只是很小的一部分,更多的信息藏在“黑暗”之中。






      一、實(shí)錘電泳圖造假

      (1)在 ImageJ 中打開(kāi)該圖片(文章中截圖即可)

      圖片

      (2)調(diào)節(jié)圖像亮度與對(duì)比度(Image -> Adjust -> Brightness/Contrast)

      圖片

      可以發(fā)現(xiàn) lane 3 的出現(xiàn)了異常的外框,這是因?yàn)槠唇釉斐傻?/strong>。局部放大后會(huì)發(fā)現(xiàn),這條 lane 的位置有明顯的偏移:

      圖片

      如果 Analyze -> Plot Profile,則可以看得更加清楚,lane3 的背景和其他 lane 明顯不同:

      圖片

      在最后的調(diào)查報(bào)告中 [3][4],證實(shí)了小保方晴子確實(shí)在 Figure1i 中進(jìn)行了圖片拼接造假:

      圖片

      細(xì)心的同學(xué)可能還會(huì)在圖上發(fā)現(xiàn)一個(gè)十字,我猜測(cè)可能是 PS 或者 AI 拼圖時(shí)候留下的,可能是留給讀者的一個(gè) 彩蛋

      圖片






      二、實(shí)錘圖像重用

      (1)在 ImageJ 中打開(kāi)這兩張圖片

      圖片

      框選 Figure1b 的第三張圖和 Figure2g 下面那張圖,(Image -> Duplicate)單獨(dú)提取出來(lái):

      圖片

      這時(shí)候好像看起來(lái)有些端倪,但可能有些人覺(jué)得不太確定。

      (2)旋轉(zhuǎn)圖片(Image -> Transform -> Rotate)

      旋轉(zhuǎn) Figure2g:

      圖片

      在 Figure1b 畫(huà)一個(gè)矩形框:

      圖片

      (3)圖片填充(Edit -> Selection -> Image to selection)

      選擇把 Figure2g 填充到矩形框中,透明度為 50%:

      圖片

      最后會(huì)發(fā)現(xiàn),圖像的胎盤(pán)部分可以完美重合:

      圖片

      但其實(shí)如果調(diào)整亮度、對(duì)比度,發(fā)現(xiàn)不了明顯的圖像重用痕跡:

      圖片






      做科研一定要避免這類(lèi)的學(xué)術(shù)造假,關(guān)于圖像的處理和應(yīng)用標(biāo)準(zhǔn),Nature 有詳細(xì)的描述:

      https://www./nature-portfolio/editorial-policies/image-integrity

      另一篇 2004 年關(guān)于圖像篡改標(biāo)準(zhǔn)的文章[5],在今天也依然有借鑒意義:

      圖片

      請(qǐng)引以為戒。






      參考文獻(xiàn):

      1.Obokata, H. et al. Stimulus-triggered fate conversion of somatic cells into pluripotency. Nature505, 641–647 (2014)

      2.Obokata, H. et al. Bidirectional potential in reprogrammed cells with acquired pluripotency. Nature505, 676–680 (2014)

      3.Obokata, H. et al. Retraction: stimulus-triggered fate conversion of somatic cells into pluripotency. Nature 511, 112 (2014)

      4.Obokata, H. et al. Retraction: bidirectional potential in reprogrammed cells with acquired pluripotency. Nature 511, 112 (2014)

      5.Rossner M , Yamada K M . What's in a picture? The temptation of image manipulation[J].Journal of Cell Biology, 2004, 166(1):11-15.


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      作者 | Treasure琛
      排版 | 小樂(lè)喵喵   

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