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      硬核生物信息學系列匯總
      
                    
                    
                    
                    
      
                         新用戶4064dVjo
                        
                        
                        2025-05-24
                        
                             發(fā)布于北京
                        
                    
      
                    
      
                        
                        
      
                    
      
                    
                    
      
                        
      
                            
                        
      
                        
      
                            
                                
      
                                    
                                        
      

                                        
                                        

                                        
      01
       R語言基礎
      Scientific Research
      觀觀老師
      手把手教你組學分析！
      R語言 | 第1期. 聽說你因為不會安裝R包而放棄入門R語言？

      R語言 | 第2期. 文件導入
      R語言 | 第3期. 讓你對自己的數(shù)據(jù)明明白白
      R語言 | 第4期. 從原始數(shù)據(jù)到可視化結(jié)果，這個必會的技能你學會了嗎

      R語言 | 第5期. 你知道如何快速篩選你的變量和觀測樣本嗎？
      R語言 | 第6期. 變量修改大全
      R語言 | 第7期. 數(shù)據(jù)合并大全
      R語言 | 第8期. R語言繪圖臨門一腳
      R語言 | 第9期. 匯總數(shù)據(jù)加速包
      R語言 | 第10期. 字符串匹配，小菜一碟！


      R語言 | 第11期. 字符串修改
      R語言 | 第12期. 字符串排序、拼接和分割
      R語言 | 第13期. apply家族入門應用
      R語言 | 第14期. ggplot2初識
      R語言 | 第15期. ggplot2柱狀圖系列
      R語言 | 第16期. ggplot2氣泡圖系列
      R語言 | 第17期. 讓chatGPT教你ggplot2
      R語言 | 第18期. 無代碼ggplot2不香嗎？
      R語言 | 第19期. 無代碼ggplot2不香嗎？-第二彈

      R包｜第1期. 緒論
      R包｜第2期. 你真的了解Dotplot嘛？
      R包｜第3期. 單細胞上游！Cellranger包全解！
      02
      Bulk RNA測序
      Scientific Research
      Bulk RNA-seq | 第1期. 快2024年了，還有必要學習Bulk RNA-seq？
      Bulk RNA-seq | 第2期. 零基礎畫主成分分析(PCA)圖
      Bulk RNA-seq | 第3期. 基因ID轉(zhuǎn)換，一鍵搞定
      Bulk RNA-seq | 第4期. 差異分析三巨頭，該了解一下了
      Bulk RNA-seq | 第5期. 關于熱圖，你所不知道的
      Bulk RNA-seq | 第6期. 火山圖，不是你想的那樣
      Bulk RNA-seq | 第7期. GO富集，我收藏了
      Bulk RNA-seq | 第8期. KEGG富集，我收藏了
      Bulk RNA-seq | 第9期. GSEA富集，不一樣的富集分析
      Bulk RNA-seq | 第10期. GSVA富集，給富集分析畫一個句號
      小白也能看懂的Bulk RNA-seq思路 | 第1期. 運用轉(zhuǎn)錄組測序繪制疾病圖譜
      小白也能看懂的Bulk RNA-seq思路 | 第2期. 不知道研究哪個分子哪條通路？轉(zhuǎn)錄組測序來幫你！
      小白也能看懂的Bulk RNA-seq思路 | 第3期. 還是太全面了！轉(zhuǎn)錄組測序?qū)ふ翌A后相關細胞類型和靶基因+揭示下游分子通路
      03
      圖解單細胞RNA測序
      Scientific Research
      圖解單細胞 | 第1期. UMAP或tSNE降維聚類（再不上車，你就真的錯過了?。?/a>
      圖解單細胞 | 第2期. pseudo-bulk將scRNA-seq數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)化為bulk RNA-seq數(shù)據(jù)
      圖解單細胞 | 第3期. 驚！看完這篇，我竟學會了單細胞轉(zhuǎn)錄組測序組學最常見的熱圖
      圖解單細胞 | 第4期. 尋找疾病致病細胞或保護細胞，原來是用這種方法！
      圖解單細胞 | 第5期. 這種形似樹枝的圖到底怎么看
      圖解單細胞 | 第6期. 好不容易看懂了UMAP圖，但為什么細胞上又有箭頭了呢
      圖解單細胞 | 第7期. 圓圈和復雜的連線
      圖解單細胞 | 第8期. 富集分析里的MM豆，也能吃嗎？
      圖解單細胞 | 第9期. 除了GO，KEGG，還能用什么富集分析？
      圖解單細胞 | 第10期. 單細胞分子層面分析——轉(zhuǎn)錄因子分析
      圖解單細胞 | 第11期. 單細胞研究思路？看完這篇你就明白
      圖解單細胞 | 第12期. 如何整合bulk RNA和scRNA數(shù)據(jù)？
      圖解單細胞 | 第13期. 單細胞WGCNA分析——hdWGCNA
      圖解單細胞 | 第14期. 單細胞聯(lián)合GWAS分析


      04
      單細胞RNA測序數(shù)據(jù)分析
      Scientific Research
      單細胞測序 | 第1期. 單細胞測序：揭開生命奧秘的鑰匙
      單細胞測序 | 第2期. 下游數(shù)據(jù)質(zhì)控知多少
      單細胞測序 | 第3期. Seurat之PBMC分析標準化流程
      單細胞測序 | 第4期. 寫文章時需要用到的單細胞轉(zhuǎn)錄組測序原理
      單細胞測序 | 第5期. 單細胞測序文件面面觀
      單細胞測序 | 第6期. 10X genomics 上游分析-cellranger介紹
      單細胞測序 | 第7期.10X genomics 上游分析-cellranger應用
      單細胞測序 | 第8期. 一文打通單細胞測序研究思路
      單細胞測序 | 第9期. Zenodo一個寶藏公共數(shù)據(jù)庫和單細胞的不解之緣
      單細胞測序 | 第10期. 生物信息學必須了解的數(shù)據(jù)庫
      單細胞測序 | 第11期. 不會還有人不知道這個免費一年的云服務吧?。?/span>
      單細胞測序 | 第12期. 單細胞分析數(shù)據(jù)下載、導入和合并
      單細胞組學 | 第13期. 單細胞測序中竟然存在雙細胞？
      單細胞組學 | 第14期. 想發(fā)單細胞測序文章？這一步必學！
      單細胞組學 | 第15期. 一份強烈推薦收藏的細胞周期校正寶典！
      單細胞組學 | 第16期. 不可不知的單細胞流程
      單細胞組學｜第17期. 找到Cluster的領頭羊
      單細胞組學｜第18期. 單細胞注釋不再是煩惱！
      單細胞組學｜第19期. 單細胞數(shù)據(jù)分析的核心環(huán)節(jié)，必學！
      單細胞組學 | 第20期. 美無極限——卷起來的UMAP圖美化方案
      單細胞組學 |  第21期. 點亮數(shù)據(jù)星空——Dotplot圖繪制技巧揭秘
      單細胞組學 |  第22期. 單細胞轉(zhuǎn)錄組基礎分析流程詳解
      單細胞組學 | 第23期. 單細胞數(shù)據(jù)分析的靈魂，學起來！
      單細胞組學 | 第24期. 找到屬于你的細胞亞群！
      單細胞組學 ｜第25期. 單細胞亞群細分
      單細胞組學｜第26期. 一個函數(shù)搞定單細胞富集分析！
      單細胞組學｜第27期. 想發(fā)高分？干濕結(jié)合才是王炸！
      單細胞組學 | 第28期. 擬時序分析，看這里！
      單細胞思路 | 第1期 必學習的最常規(guī)單細胞思路 | 第2期 單細胞中的資源庫
      單細胞思路 | 第3期 找到靶點分子后可以直接測序！
      單細胞思路 | 第4期 預測標志物，單細胞和疾病穩(wěn)穩(wěn)聯(lián)系！
      有手就會的單細胞轉(zhuǎn)錄組 | 1.數(shù)據(jù)導入
      有手就會的scRNA-seq ｜2.Seurat對象
      有手就會的scRNA-seq ｜3.質(zhì)控思路
      有手就會的scRNA-seq｜4. 為什么老是畫不好小提琴圖？
      有手就會的scRNA-seq｜5. 還在糾結(jié)雙細胞質(zhì)控方法嗎！一文說清楚
      有手就會的scRNA-seq｜6. 不讀完這篇，都不敢說自己懂單細胞質(zhì)控！
      有手就會的scRNA-seq｜7. 單細胞批次效應，最全攻略！
      有手就會的scRNA-seq｜8. 不搞懂這“三步走”，別說你會單細胞分析！


































       
      05
      代謝組學
      Scientific Research
      代謝組學 | 第1期. 2024年了，上車代謝組學還不晚
      代謝組學 | 第2期. 關于代謝組學，你必須了解的事
      代謝組學 | 第3期. 即將發(fā)車，快來學習代謝組學基本流程與技術
      代謝組學 | 第4期. 快來學，一文掌握代謝組學上游分析
      代謝組學 | 第5期. 代謝組學多元統(tǒng)計分析，你學會了嗎
      代謝組學 | 第6期. 富集分析，代謝組學也要有！
      代謝組學 | 第7期. 圖解代謝組學，有圖有真相
      代謝組學 | 第8期. 有圖有真相，代謝組學圖解之多組學進階
      代謝組學 | 第9期. 代謝組學升級到空間層面會發(fā)生什么

      代謝組思路 | 第1期. 代謝組學基本思路——描繪圖譜&尋找新藥治療靶點
      代謝組思路 | 第2期. 代謝組學思路從基礎到進階——識別高?；颊?預測預后
      代謝組思路 | 第3期. 代謝組學思路進階——預測預后
      代謝組思路 | 第4期. 代謝組學聯(lián)合轉(zhuǎn)錄組學，助力代謝重編程
      （更新于2025-05-20）
      讓醫(yī)學科研有跡可循
      MASCU
      編輯：直觀
      編審：直觀
      
                                          		
                                
      
                                  
                        
      
                    
      



                
      
                
      
                    
                    
                        
      
                            
                                
        
                                    		
                        
        
                            
                
        
                
        
                
                
                
        
                
        


                

                
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