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      套娃似的找了四個文獻才找到的巨噬細胞 M1 和 M2 signatures,不來看一下嗎?

       健明 2025-05-26 發(fā)布于廣東

      為了繪制張澤民大佬團隊的新發(fā)表文獻《Distinct cellular mechanisms underlie chemotherapies and PD-L1 blockade combinations in triple-negative breast cancer》中的雙向小提琴圖,我找了一下文獻中 M1 和 M2 signatures,發(fā)現(xiàn)文章中沒有提到!下面這個圖是對巨噬細胞的亞群使用 M1 和 M2 signatures 兩個基因集做的一個打分。

      然后,我搜了一篇文章,忘記怎么搜到的了,標(biāo)題為《Single-cell dissection of cellular and molecular features underlying human cervical squamous cell carcinoma initiation and progression》,文獻中用這兩個 M1 和 M2 signatures做的 tsne 散點圖的打分分布,如下:

      查看文獻細節(jié)發(fā)現(xiàn)還不是這個文獻自己的!但是好歹給了一個參考文獻 32,哭死!

      看參考文獻32,標(biāo)題為《Single-Cell Map of Diverse Immune Phenotypes in the Breast Tumor Microenvironment》,人家提供了一個附件列表(可以直接下載Table S4使用,很方便)啊:

      列表如下:

      M1 Signature 來源

      M2Suppressive Signature 來源

      具體的基因列表

      其他細胞的signature也有,超好?。?/span>

      英文術(shù)語
      中文術(shù)語
      Treg
      T細胞調(diào)節(jié)
      CD8 T Cell Activation
      CD8 T細胞激活
      Anti-inflammatory
      抗炎癥
      Anergy
      無反應(yīng)性
      Pro inflammatory
      促炎癥
      Lipid mediators
      脂質(zhì)介質(zhì)
      Glycolysis
      糖酵解
      TCA cycle
      三羧酸循環(huán)
      Pentose Phosphate Pathway
      戊糖磷酸途徑
      Glycogen Metabolism
      糖原代謝
      Glucose Deprivation
      葡萄糖剝奪
      M1 Macrophage Polarization
      M1型巨噬細胞極化
      M2 Macrophage Polarization
      M2型巨噬細胞極化
      Cytolytics effector pathway
      細胞毒性效應(yīng)途徑
      Type I Interferon response
      Ⅰ型干擾素反應(yīng)
      Type II Interferon Response
      Ⅱ型干擾素反應(yīng)
      Hypoxia/HIF regulated
      缺氧/HIF調(diào)控
      TCell Terminal Differentiation
      T細胞終末分化
      G1/S
      G1/S期
      G2/M
      G2/M期

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