為了繪制張澤民大佬團隊的新發(fā)表文獻《Distinct cellular mechanisms underlie chemotherapies and PD-L1 blockade combinations in triple-negative breast cancer》中的雙向小提琴圖,我找了一下文獻中 M1 和 M2 signatures,發(fā)現(xiàn)文章中沒有提到!下面這個圖是對巨噬細胞的亞群使用 M1 和 M2 signatures 兩個基因集做的一個打分。 ![]() 然后,我搜了一篇文章,忘記怎么搜到的了,標(biāo)題為《Single-cell dissection of cellular and molecular features underlying human cervical squamous cell carcinoma initiation and progression》,文獻中用這兩個 M1 和 M2 signatures做的 tsne 散點圖的打分分布,如下: ![]() 查看文獻細節(jié)發(fā)現(xiàn)還不是這個文獻自己的!但是好歹給了一個參考文獻 32,哭死! ![]() 看參考文獻32,標(biāo)題為《Single-Cell Map of Diverse Immune Phenotypes in the Breast Tumor Microenvironment》,人家提供了一個附件列表(可以直接下載Table S4使用,很方便)啊: ![]() 列表如下:M1 Signature 來源![]() M2Suppressive Signature 來源![]() 具體的基因列表![]() 其他細胞的signature也有,超好?。?/span>還不去下載下來嗎! |
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