quick go 幫助中文

zhuqiaoxiaoxue 2015-09-24

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內(nèi)嵌幫助

內(nèi)聯(lián)幫助可通過點(diǎn)擊任何地方的鏈接

中找到。

內(nèi)聯(lián)幫助由來自各部分的參考手冊(cè)。

全球工具欄

全球工具欄是從QuickGO的任何頁(yè)面訪問。下列功能可以從全局工具欄進(jìn)行訪問;

1. QuickGO搜索框 - 可通過關(guān)鍵字或標(biāo)識(shí)符搜索GO術(shù)語(yǔ)或搜索蛋白的名稱或加入。

2. Web服務(wù) - QuickGO用品GO術(shù)語(yǔ)信息，并通過REST Web服務(wù)GO注釋數(shù)據(jù)。

3.數(shù)據(jù)集 - 即QuickGO包含的數(shù)據(jù)的細(xì)節(jié)

4.期限籃- GO術(shù)語(yǔ)可以通過點(diǎn)擊添加到您的籃子一詞

出現(xiàn)毗鄰GO方面的圖標(biāo)。

欲了解更多信息，請(qǐng)參見下面的期限籃“部分。

注解工具欄

注釋工具欄無法顯示頁(yè)面的注釋，如注釋下載頁(yè)面訪問。

下列功能可在注解工具欄進(jìn)行訪問;

1.顯示 - 注釋表是按客戶需要選擇顯示哪些列

2. ID映射 ??- 這種過濾器用于不同的序列標(biāo)識(shí)符類型之間切換，默認(rèn)為UniProtKB的加入。

3.過濾 - 注釋集可以由幾個(gè)參數(shù)，包括序列標(biāo)識(shí)符，??類群，GO ID和證據(jù)碼進(jìn)行過濾。

4.統(tǒng)計(jì) - 各種統(tǒng)計(jì)信息計(jì)算當(dāng)前的注解集，包括許多不同的蛋白質(zhì)，GO ID的數(shù)量，證據(jù)碼數(shù)和類群標(biāo)識(shí)符的數(shù)量。統(tǒng)計(jì)上更新即時(shí)對(duì)注解數(shù)據(jù)集中的每個(gè)過濾動(dòng)作。

5.下載 - 注釋集可以以多種格式，包括基因關(guān)聯(lián)的文件，蛋白質(zhì)列表和FASTA下載。的'限制'應(yīng)該增加，以確保在該組的所有注解被下載（在一組注解的總數(shù)目被發(fā)現(xiàn)在注解表的左上方）。有一個(gè)選項(xiàng)，輸出文件gzip壓縮。

在短期歷史工具欄

歷史記錄選項(xiàng)

默認(rèn)GO項(xiàng)歷史記錄顯示過去的500修改為所有GO條款。然而，除了點(diǎn)擊選項(xiàng)卡，時(shí)間戳和走在默認(rèn)的顯示標(biāo)識(shí)符，用戶還可以通過添加參數(shù)輸入頁(yè)面的URL，使用歷史記錄選項(xiàng)的形式定制的GO長(zhǎng)期變化的顯示。因此，用戶可以使用指定最感興趣，對(duì)他們的書簽定期更新所產(chǎn)生的URL變化的類型。

日期規(guī)格

在歷史記錄選項(xiàng)對(duì)話框允許用戶通過設(shè)置“從”，指定感興趣的明確日期范圍和“到”參數(shù); 這將限制顯示到（含）日期范圍內(nèi)記錄這些修改的數(shù)據(jù)。

另外，在“周期”參數(shù)，用戶可以查看指定日期之前發(fā)生過天（S），周（S），月（S）或年（S）特定數(shù)量的GO長(zhǎng)期變化。

如果沒有“到”日期值被輸入，則周期將是相對(duì)于當(dāng)前日期。然而，如果指定了“到”值，則“周期”的值將顯示在時(shí)間表記錄直到和包括該指定的日期。

例如，如果“到”設(shè)置為2011-06-01和“期間”設(shè)定為6瓦特，然后QuickGO將顯示記錄在大小周期，2011年六月結(jié)束了第一這些變化。

分類

用戶可以使用此字段來指定哪些類型的長(zhǎng)期變化，他們?cè)敢夥祷亍?/p>

條款

GO條款可以在此字段中輸入限制所顯示的長(zhǎng)期變化。請(qǐng)注意，只有變化做出直接列出的條款將被顯示出來，不稱之為后代。

限制

記錄返回的默認(rèn)數(shù)量為500，但這個(gè)限制可以增加/減少用戶。為了防止可能的瀏覽器的問題，最大的上限為10,000。

期限籃

GO術(shù)語(yǔ)可以通過點(diǎn)擊被添加到期限籃

出現(xiàn)相鄰GO術(shù)語(yǔ)圖標(biāo)。

以這種方式，一組的GO術(shù)語(yǔ)可以被選擇，然后可以用于檢索相關(guān)聯(lián)的注釋

主頁(yè)

QuickGO主頁(yè)。

幫幫我

QuickGO幫助手冊(cè)。

下載

從的UniProt-GOA網(wǎng)站下載基因關(guān)聯(lián)的文件。

從GO術(shù)語(yǔ)關(guān)鍵字搜索返回的檢索GO術(shù)語(yǔ)列表時(shí)列的說明顯示

GO本體

該GO包含三個(gè)本體術(shù)語(yǔ)：分子功能，生物過程和細(xì)胞組分。

顯示的值表示，其中三個(gè)本體一個(gè)GO長(zhǎng)期駐留的。

GO術(shù)語(yǔ)標(biāo)識(shí)符

為顯示GO術(shù)語(yǔ)獨(dú)特的，穩(wěn)定的數(shù)值GO術(shù)語(yǔ)標(biāo)識(shí)符

點(diǎn)擊一個(gè)GO標(biāo)識(shí)符將帶你到GO術(shù)語(yǔ)詳細(xì)信息頁(yè)面，在GO來看，其中的詳細(xì)信息，以及對(duì)使用這一術(shù)語(yǔ)的任何注釋的列表。

單擊其中一個(gè)

圖標(biāo)，使用戶可以添加鄰GO期限為期限籃

這樣產(chǎn)生的GO術(shù)語(yǔ)列表可用于檢索包含一個(gè)或多個(gè)這些GO術(shù)語(yǔ)注解

GO術(shù)語(yǔ)名稱

為顯示GO術(shù)語(yǔ)主的名字

過時(shí)的標(biāo)簽

當(dāng)GO期限已過時(shí)，一個(gè)紅色的“過時(shí)”的標(biāo)簽會(huì)出現(xiàn)相鄰的上市GO術(shù)語(yǔ)。

點(diǎn)擊這種“過時(shí)的”標(biāo)記將生成一個(gè)彈出窗口，將詳細(xì)說明原因，后面的詞的obsoletion。

定義或同義詞標(biāo)簽

當(dāng)搜索返回基于匹配無論是在GO術(shù)語(yǔ)的描述或同義詞部分找到單詞GO術(shù)語(yǔ)，

然后是一個(gè)“說明”或“同”的標(biāo)簽會(huì)出現(xiàn)毗鄰上市GO術(shù)語(yǔ)。

點(diǎn)擊這樣的標(biāo)簽將產(chǎn)生彈出窗口示出的術(shù)語(yǔ)的定義或同義詞，具有匹配字（多個(gè)）突出。

從蛋白質(zhì)的關(guān)鍵字搜索返回的檢索到的蛋白質(zhì)列表時(shí)列的說明顯示

UniProtKB加入

從獨(dú)特的蛋白標(biāo)識(shí)的UniProt知識(shí)庫(kù)

點(diǎn)擊加入將帶你到一個(gè)包含所有GO注釋蛋白質(zhì)的頁(yè)面。

基因符號(hào)

該匹配于UniProtKB登錄號(hào)基因符號(hào)

分類

品種的展示蛋白質(zhì)學(xué)名

蛋白質(zhì)名稱

通過UniProtKB提供蛋白質(zhì)名

該值的GO術(shù)語(yǔ)的詳細(xì)信息頁(yè)面說明

定義

術(shù)語(yǔ)名稱的說明

注解

GO上長(zhǎng)期使用的定義和言論的澄清

二級(jí)標(biāo)識(shí)

二級(jí)GO術(shù)語(yǔ)標(biāo)識(shí)符列表這個(gè)詞替換

GONUTS頁(yè)

鏈接到與此GO任期GONUTS維基頁(yè)面

同義詞

同義詞在意到術(shù)語(yǔ)名稱，與由同義詞范圍給定的名稱和同義詞之間的關(guān)系的指示密切相關(guān)的替代單詞或短語(yǔ)。

該作用域GO同義詞：

確切 - 完全等效互換的術(shù)語(yǔ)名稱，如鳥氨酸循環(huán)是尿素循環(huán)的精確同義詞
廣 - 同義詞是比一屆更廣泛的名稱，例如，細(xì)胞分裂是細(xì)胞分裂的一個(gè)廣泛的代名詞
窄 - 同義詞是窄或比一屆名字更精確，例如，嘧啶二聚體修復(fù)通過光解是光反應(yīng)修窄的代名詞
相關(guān) - 這些術(shù)語(yǔ)在某種程度上上面沒有涉及，如細(xì)胞色素BC1復(fù)雜的輔酶，細(xì)胞色素C還原酶活性相關(guān)同義詞相關(guān)，毒力是發(fā)病的相關(guān)代名詞

有關(guān)詳情，請(qǐng)參閱http://www./GO.ontology.structure.shtml#opt。

外部參照

交叉引用外部數(shù)據(jù)庫(kù)條目相關(guān)的術(shù)語(yǔ)。

祖圖

在GO的截面的視覺顯示器向非循環(huán)圖（DAG）的單個(gè)或一組GO術(shù)語(yǔ)。條款中的GO是由一個(gè)或多個(gè)“關(guān)系”聯(lián)系到父（更普遍的）條款和常子（更具體的）條款

祖先表

在GO的部分替代顯示，提供連接GO方面關(guān)系的簡(jiǎn)明視圖

關(guān)系的關(guān)鍵

條款中的GO可以彼此連接由三個(gè)不同的關(guān)系：

is_a

部分

調(diào)整對(duì)象

有關(guān)關(guān)系的更多詳細(xì)信息，請(qǐng)參見這里。

兒童條款

兒童來講是，現(xiàn)有的時(shí)候，直接鏈接到選定的GO術(shù)語(yǔ)更專業(yè)的GO術(shù)語(yǔ)。

蛋白注釋

GO條款和蛋白質(zhì)標(biāo)識(shí)之間建立關(guān)聯(lián)。

統(tǒng)計(jì)

蛋白質(zhì)注解共同occurence的GO方面的統(tǒng)計(jì)。

列在表中注釋的描述

數(shù)據(jù)庫(kù)

此列顯示數(shù)據(jù)庫(kù)的名稱來自其注釋的基因或蛋白質(zhì)識(shí)別發(fā)送器（例如，UniProtKB，以RefSeq，MGI）。

請(qǐng)點(diǎn)擊工具欄中的“ID映射”按鈕，如果你想有顯示的標(biāo)識(shí)映射到不同的序列數(shù)據(jù)庫(kù)。

該字段等同于GO聯(lián)盟的的“DB”（列1）基因的關(guān)聯(lián)文件。

基因產(chǎn)品編號(hào)

此列顯示已注明去序列標(biāo)識(shí)符。

請(qǐng)點(diǎn)擊工具欄中的“濾鏡”按鈕，如果你想看到注解序列標(biāo)識(shí)符的具體名單。

另外，點(diǎn)擊工具欄中的“ID映射”按鈕，如果你想有顯示的標(biāo)識(shí)映射到不同的序列數(shù)據(jù)庫(kù)。

該字段等同于GO聯(lián)盟的的“DB對(duì)象ID”（第2列）基因的關(guān)聯(lián)文件。

產(chǎn)品形態(tài)ID

此列顯示任何亞型標(biāo)識(shí)符（剪接變異體）的GO條款已明確注明為。

如果沒有同種型標(biāo)識(shí)符的注釋被指定，那么就沒有在此列中顯示的值。

該字段等同于GO聯(lián)盟的的“基因產(chǎn)品形態(tài)ID”列（列17）基因的關(guān)聯(lián)文件。

符

此列顯示相匹配的“ID”欄提供的標(biāo)識(shí)符號(hào)。

一個(gè)官方批準(zhǔn)的基因符號(hào)將被用于在該領(lǐng)域時(shí)可用?？商娲兀渌蚍?hào)或基因座的名稱被應(yīng)用。

如果沒有符號(hào)是可用的，該標(biāo)識(shí)符在塔2施加（DB_Object_ID）將被使用。

該字段等同于“DB_Object_Symbol'的GO聯(lián)盟的中（專欄3）基因的關(guān)聯(lián)文件。

預(yù)選賽

此列用于修改注釋的解釋。

當(dāng)一個(gè)注解應(yīng)用，值可以等于'沒'，'contributes_to“或”colocalizes_with“之一。

在預(yù)選賽進(jìn)一步的細(xì)節(jié)可以發(fā)現(xiàn)這里。

如果你想明確地篩選限定值，這個(gè)注解集，請(qǐng)單擊工具欄中的“過濾器”按鈕。

該字段等同于“預(yù)選賽”的GO聯(lián)盟的中（專欄3）基因的關(guān)聯(lián)文件。

GO標(biāo)識(shí)

該列顯示GO術(shù)語(yǔ)的獨(dú)特，穩(wěn)定的標(biāo)識(shí)符。

該字段等同于“GO ID'的GO聯(lián)盟的（第5列）基因的關(guān)聯(lián)文件。

原GO ID

此列顯示原始注釋的GO ID時(shí)，注釋已經(jīng)精簡(jiǎn)到更高級(jí)別的條款。

參考

此列顯示一個(gè)引用到一個(gè)參考，或者一個(gè)搜索PubMed引用或GO_REF標(biāo)識(shí)符，它包含任一支撐所述注解或電子方法的細(xì)節(jié)的數(shù)據(jù)施加到產(chǎn)生的注釋。

該字段等同于“DB：參考”的GO聯(lián)盟的中（專欄6）基因的關(guān)聯(lián)文件。

佐證

GO術(shù)語(yǔ)被分配給基于不同證據(jù)蛋白質(zhì)。這是通過一個(gè)證據(jù)碼表示。又見GO聯(lián)盟文檔

該字段等同于GO聯(lián)盟的的“證據(jù)法典”（第7列）基因的關(guān)聯(lián)文件。

隨著

此列顯示一個(gè)附加標(biāo)識(shí)，以支持使用某些證據(jù)的代碼（包括國(guó)際能源署（IEA），工業(yè)生產(chǎn)指數(shù)，IGI，IC和ISS的證據(jù)）的注釋。

示例：UniProtKB：O00341，InterPro的：IPROO1878，ENSEMBL：ENSG00000136141，GO：0000001，EC：3.1.22.1

該字段等同于“有或從'GO聯(lián)盟的的（第8列）基因的關(guān)聯(lián)文件。

方面

這列顯示該GO術(shù)語(yǔ)所屬的本體的單個(gè)字母縮寫。一的任一F（分子F油膏），P（生物P rocess）或C（蜂窩?omponent）。

該字段等同于GO聯(lián)盟的的“看點(diǎn)”（第9欄）基因的關(guān)聯(lián)文件。

命名

此列顯示蛋白質(zhì)的名稱。

該字段等同于“數(shù)據(jù)庫(kù)對(duì)象名稱'的GO聯(lián)盟的的（10列）基因的關(guān)聯(lián)文件。

代名詞

此列顯示與蛋白質(zhì)相關(guān)的同義詞或基因符號(hào)。

該字段等同于“數(shù)據(jù)庫(kù)對(duì)象的同義詞”的GO聯(lián)盟的的（11列）基因的關(guān)聯(lián)文件。

類型

此列顯示的基因產(chǎn)物，已注解的類型。

該字段等同于GO聯(lián)盟的的“DB對(duì)象類型”（列12）基因的關(guān)聯(lián)文件。

分類群

此列顯示的分類標(biāo)識(shí)的品種被注釋。

該字段等同于“分類群”的GO聯(lián)盟的的（13列）基因的關(guān)聯(lián)文件。

分類群名稱

此列顯示相匹配的分類標(biāo)識(shí)符被注釋的品種名稱。

迄今

這列顯示注釋作出的日期。

該字段等同于GO聯(lián)盟的的'日期'（列14）基因的關(guān)聯(lián)文件。

分配人

此列指示其創(chuàng)建的注釋的數(shù)據(jù)庫(kù)。在GO注解可以不是沒有數(shù)據(jù)源的確認(rèn)被復(fù)制。

該字段等同于“分配者”的GO聯(lián)盟的的（15列）基因的關(guān)聯(lián)文件。

GO術(shù)語(yǔ)名稱

此列顯示匹配在注釋中使用的GO標(biāo)識(shí)的GO術(shù)語(yǔ)名稱。

原GO術(shù)語(yǔ)名稱

此列顯示原始注釋時(shí)，注釋已經(jīng)精簡(jiǎn)到更高的層次來講GO術(shù)語(yǔ)名稱。

次序

該列顯示注釋序列的氨基酸長(zhǎng)度。點(diǎn)擊的長(zhǎng)度將導(dǎo)致包含實(shí)際序列的彈出框。

列在長(zhǎng)期的歷史/更改日志說明

時(shí)間戳

變更條款顯示在根據(jù)由的UniProt-GOA數(shù)據(jù)庫(kù)中登記的時(shí)間戳日期降序排列。

點(diǎn)擊一個(gè)日期將顯示被記錄在該日的所有條款，這些改變。

GO ID

不同的變化在GO術(shù)語(yǔ)重點(diǎn)圍繞穩(wěn)定GO標(biāo)識(shí)符。

點(diǎn)擊一個(gè)GO標(biāo)識(shí)符將提供所選擇的GO術(shù)語(yǔ)，其中包括記錄這個(gè)詞的所有更改的完整歷史（在更改日志選項(xiàng)卡），完整的數(shù)據(jù)。

GO術(shù)語(yǔ)名稱

相關(guān)GO標(biāo)識(shí)符的GO術(shù)語(yǔ)名稱。

行為

改變本體被記錄在的UniProt-GOA數(shù)據(jù)庫(kù)作為“新增”，“更新”或“刪除”動(dòng)作。

請(qǐng)注意，在這些變化的顯示順序是由在其中的行動(dòng)是在數(shù)據(jù)庫(kù)中執(zhí)行的順序決定。

這可能會(huì)導(dǎo)致在那里記錄為相同的整體本體更新的一部分該動(dòng)作可能會(huì)被顯示在一個(gè)非直觀順序的情況; 這是不幸的是，不可避免的。

分類

變化是通過記錄到GO術(shù)語(yǔ)的具體方面的變化識(shí)別。

當(dāng)前審計(jì)的類別有：TERM，OBSOLETION，定義，同義詞關(guān)系，XREF??，中學(xué)和苗條。

除了“所有更改”選項(xiàng)卡，其中顯示的變化在所有類別中，也有對(duì)各個(gè)類別單獨(dú)的標(biāo)簽。

詳細(xì)信息

這列包含關(guān)于變更的其他詳細(xì)信息; 它的內(nèi)容可能有所不同取決于變更類別。

例如，對(duì)于關(guān)系類別它顯示目標(biāo)的GO術(shù)語(yǔ)的關(guān)系和所述標(biāo)識(shí)符和名稱的類型。

預(yù)選賽

在不預(yù)選賽

不被用于做出明確說明該基因產(chǎn)物不與GO術(shù)語(yǔ)相關(guān)聯(lián)。GO 聯(lián)盟的文檔

該Contributes_to預(yù)選賽

'Contributes_to“出現(xiàn)在一個(gè)GO注釋時(shí)的蛋白復(fù)合物的功能變得容易，但不直接由它的亞基1進(jìn)行。GO 聯(lián)盟的文檔

該Colocalizes_with預(yù)選賽

'Colocalizes_with“出現(xiàn)在一個(gè)GO注解以指示與細(xì)胞器或復(fù)雜的蛋白的一過性或外圍關(guān)聯(lián)。GO 聯(lián)盟的文檔

GO參考

GO_REF：0000002

從應(yīng)用程序中創(chuàng)建的電子標(biāo)注的InterPro到GO映射在UniProtKB。GO 協(xié)會(huì)文件

GO_REF：0000003

從應(yīng)用程序的創(chuàng)建電子注解酶委員會(huì)號(hào)GO映射在UniProtKB。GO 協(xié)會(huì)文件

GO_REF：0000004

從應(yīng)用程序中創(chuàng)建的電子注解SWISS-PROT關(guān)鍵字來GO映射在UniProtKB。GO 協(xié)會(huì)文件

GO_REF：0000015

手工標(biāo)注創(chuàng)建時(shí)策展人已經(jīng)找遍了所有相關(guān)文獻(xiàn)的注釋蛋白，沒有發(fā)現(xiàn)信息支持注釋任何GO長(zhǎng)期在一個(gè)特定的本體。這個(gè)參考只能與三個(gè)術(shù)語(yǔ)使用; 分子功能GO：0003674，生物制程GO：0008150和細(xì)胞組分 GO：0005575。GO 協(xié)會(huì)文件

GO_REF：0000019

從實(shí)驗(yàn)證實(shí)手工GO注釋的數(shù)據(jù)傳送到使用ENSEMBL直向同源基因數(shù)據(jù)創(chuàng)建電子注解。的UniProt-GOA文檔

GO_REF：0000020

從應(yīng)用程序中創(chuàng)建的電子標(biāo)注HAMAP到GO映射在UniProtKB。GO 協(xié)會(huì)文件

GO_REF：0000023

從應(yīng)用程序中創(chuàng)建的電子標(biāo)注的UniProt亞細(xì)胞定位于GO映射在UniProtKB。GO 協(xié)會(huì)文件

GO_REF：0000033

由GO聯(lián)盟的參考基因組計(jì)劃從進(jìn)化樹的注解創(chuàng)建推斷標(biāo)注PANTHER數(shù)據(jù)庫(kù) 。GO 協(xié)會(huì)文件

證據(jù)法

EXP

從實(shí)驗(yàn)推斷。見GO聯(lián)盟文檔。

IDA

通過直接分析推斷。見GO聯(lián)盟文檔。

IPI

從物理互為作用的推斷。見GO聯(lián)盟文檔。

IMP

從突變表型推斷。見GO聯(lián)盟文檔。

IEP

從表達(dá)模式推斷。見GO聯(lián)盟文檔。

IGI

從遺傳相互作用推斷。見GO聯(lián)盟文檔

RCA

從審核計(jì)算分析推斷。見GO聯(lián)盟文檔。

IGC

從基因組上下文推斷。見GO聯(lián)盟文檔。

TAS

溯源作者聲明。見GO聯(lián)盟文檔。

NAS

非溯源作者聲明。見GO聯(lián)盟文檔。

我知道了

策展人推斷。見GO聯(lián)盟文檔。

ND

沒有數(shù)據(jù)。見GO聯(lián)盟文檔。

國(guó)際空間站

從序列或結(jié)構(gòu)相似性推斷。見GO聯(lián)盟文檔。

ISO

從序列直向推斷。見GO聯(lián)盟文檔。

ISA

從序列比對(duì)的推斷。見GO聯(lián)盟文檔。

ISM

從序列模型推斷。見GO聯(lián)盟文檔。

國(guó)際能源署（IEA）

電子注釋推斷。見GO聯(lián)盟文檔。

聯(lián)合occurence

術(shù)語(yǔ)的列表，其中最常注釋以相同的蛋白質(zhì)作為所選術(shù)語(yǔ)，且術(shù)語(yǔ)至少經(jīng)常注釋以相同的蛋白質(zhì)。

在代表?xiàng)l款

該條款在注釋選定的期限，并按概率比蛋白質(zhì)超過限額。

相比而言

相比術(shù)語(yǔ)：這是相對(duì)于所選擇的術(shù)語(yǔ)

PR

概率比

比較長(zhǎng)期的概率比給出選擇的術(shù)語(yǔ)來比較長(zhǎng)期的概率

=（＃在一起/選擇）/（＃比較/＃全）

長(zhǎng)期的概率估計(jì)這里的注釋，以長(zhǎng)期的蛋白質(zhì)部分。

S％

概率相似比

這兩個(gè)詞的概率比任任期的可能性

=＃一起/（＃選定+＃compared-＃在一起）

長(zhǎng)期的概率估計(jì)這里的注釋，以長(zhǎng)期的蛋白質(zhì)部分。

一同

伯爵的蛋白質(zhì)，其中既選擇和比較的術(shù)語(yǔ)注釋

相比

伯爵的蛋白質(zhì)，其中較長(zhǎng)期被標(biāo)注

選擇

蛋白質(zhì)的總次數(shù)注明所選詞

都

蛋白質(zhì)的總計(jì)數(shù)

高級(jí)注釋搜索

GO注釋集可以使用一組布爾操作的定制。

輸入一個(gè)查詢（可用字段和運(yùn)算符如下所示）到輸入框高級(jí)篩選對(duì)話框中的選項(xiàng)卡，然后按提交按鈕提交查詢。如果還設(shè)置過濾條件上的任何其他選項(xiàng)卡，它們也將被包括在查詢，及編著與您在高級(jí)選項(xiàng)卡中輸入的條件。

一般形式

查詢是做出來的標(biāo)注標(biāo)準(zhǔn)，結(jié)合運(yùn)營(yíng)商的集合。注釋標(biāo)準(zhǔn)是表單字段= value，其中??多個(gè)字段和值可以用逗號(hào)分隔的前提。該標(biāo)準(zhǔn)匹配的注釋中任何指定的字段有任何指定的值。例如，要找到任何注釋與ISA，partof或身份關(guān)系方面去：0005515或GO：0005634：

身份，ISA，partof = GO：0005515，GO：0005634

標(biāo)準(zhǔn)相結(jié)合，與下面的運(yùn)算：

操作者	用途	示例	說明
（X）	集團(tuán)運(yùn)營(yíng)商一起 - 用于澄清	（長(zhǎng)期= GO：0005515 \|證據(jù)= IPI）稅率= 9606	所有批注蛋白結(jié)合或使用人類蛋白質(zhì)的IPI證據(jù)碼
！X	沒有 - 所有注釋不賽果	！證據(jù)=國(guó)際能源署（IEA）	所有非電子注解
X??	像 - 這賽果所有注釋，其中每個(gè)蛋白質(zhì)其中之一匹配?	長(zhǎng)期= GO：0005515?證據(jù)= IDA	找到所有的蛋白質(zhì)結(jié)合的注釋，其中各蛋白的注解中的至少一個(gè)是證據(jù)IDA
X	像 - 所有注釋為每個(gè)蛋白質(zhì)，其中一人符合X	證據(jù)= IDA	發(fā)現(xiàn)所有注解到所有的蛋白質(zhì)，其中所述注釋中的至少一個(gè)是證據(jù)IDA
X和Y	而且 - 所有注釋匹配的X和Y	長(zhǎng)期= GO：0005515＆稅= 9606	所有人類蛋白結(jié)合的注解
X \| Y	或者 - 任何標(biāo)注符合標(biāo)準(zhǔn)的X或Y	稅= 9606 \|稅額= 10090	所有批注人或小鼠蛋白質(zhì)

查詢示例：

找到所有ISS注釋這些注釋的任何蛋白的蛋白質(zhì)結(jié)合了考研參考項(xiàng)：

（祖先= GO：0005515＆REF =結(jié)論：*）證據(jù)= ISS

更高級(jí)查詢的例子都可以在這里

領(lǐng)域

字段名稱	值	示例	說明
DB	蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫(kù)（標(biāo)識(shí)符類型）	UniProtKB，的UniGene，ENSEMBL	注釋要在這些數(shù)據(jù)庫(kù)中的蛋白質(zhì)
術(shù)語(yǔ)	GO標(biāo)識(shí)符直接用于注解	GO：0005515	注釋蛋白質(zhì)結(jié)合（而不是更specfic術(shù)語(yǔ)）
祖先	GO標(biāo)識(shí)符直接或間接（后代GO標(biāo)識(shí)符）的注解應(yīng)用	GO：0002080	任何其子項(xiàng)002080或：注釋GO GO：0002079，GO：0002081，GO：0033282
特性	GO標(biāo)識(shí)符直接用于注解	GO：0005515	（相同的術(shù)語(yǔ)標(biāo)準(zhǔn)）
ISA	GO標(biāo)識(shí)符與具有關(guān)系到指定的期限	GO：0005634	發(fā)現(xiàn)標(biāo)注的條款，如：GO：0043073 生殖細(xì)胞細(xì)胞核，但不要去：0005634 核本身
部分	有關(guān)系的一個(gè)部分轉(zhuǎn)到標(biāo)識(shí)符指定的期限	GO：0005634	找到注解GO：0044428 核的一部分，但不要去：0005634 核本身
調(diào)整對(duì)象	GO識(shí)別符與一個(gè)調(diào)節(jié)相對(duì)于指定的術(shù)語(yǔ)
positiveregulates	GO標(biāo)識(shí)符與正調(diào)節(jié)關(guān)系到指定的期限
negativeregulates	GO標(biāo)識(shí)符與負(fù)調(diào)控關(guān)系到指定的期限
haspart	GO標(biāo)識(shí)符與HAS部位關(guān)系到指定的期限
證據(jù)	注釋代碼證（EV）類別	IDA，IC，ISS，國(guó)際能源署（IEA）	注釋與任何這些證據(jù)
資源	注釋供應(yīng)商	的UniProt，HGNC
REF	考研還是去參考支持注釋。可以參考具體的參考標(biāo)識(shí)符或類別（類別級(jí)別，使用*后ref類型）	PUBMED：*，GO_REF：0000002，16262699	注釋參照任何醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)符，向InterPro的數(shù)據(jù)庫(kù)（參見 GO REF文檔）或以任何標(biāo)識(shí)符16262699
同	在國(guó)際能源署（IEA），國(guó)際空間站，IPI提供的其他證明資料，IC證明注釋; 見：GO 文檔。可（后為類級(jí)別，使用*類型）是指一個(gè)特定的標(biāo)識(shí)或類別	EC：2.5.1.30，IPR000092，HAMAP：*	注釋指的是這個(gè)特殊的EC代碼，這InterPro項(xiàng)目或任何HAMAP代碼
稅	注釋蛋白質(zhì)的NCBI分類標(biāo)識(shí)符	9606	人類注解
蛋白質(zhì)	指定從現(xiàn)有的數(shù)據(jù)庫(kù)中的特定序列標(biāo)識(shí)符（S）或加入（S）（見DB過濾柱）	Mm.363225，P99999	注釋任何這些收集品

現(xiàn)有運(yùn)營(yíng)商的更多信息點(diǎn)擊這里

在所有的關(guān)系苗條

此選項(xiàng)將導(dǎo)致注釋被精簡(jiǎn)高達(dá)請(qǐng)求GO術(shù)語(yǔ)的所有祖先，利用一切關(guān)系的路線。

它將使用不僅is_a，part_of，調(diào)節(jié)positively_regulates和negatively_regulates的關(guān)系，但是也未定義組合關(guān)系，如：

part_of +調(diào)控對(duì)
part_of + negatively_regulates
part_of + positively_regulates
調(diào)節(jié)+調(diào)控對(duì)

有關(guān)GO關(guān)系的信息，請(qǐng)參閱GO聯(lián)盟文檔。

整個(gè)自定義關(guān)系苗條

關(guān)系類型

	？	（祖先）
	=	（身份）
	一世	（is_a）
	P	（部分）
		（occurs_in）
		（調(diào)節(jié)）
	+	（positively_regulates）
	-	（negatively_regulates）

有關(guān)GO關(guān)系的信息，請(qǐng)參閱GO聯(lián)盟文檔。

聯(lián)系goa@如果您對(duì)結(jié)果數(shù)據(jù)的查詢。

搜索和過濾GO注釋集

使用此選項(xiàng)可以查看，GO注釋的過濾器和下載集。

QuickGO可以篩選注釋集與特定的基因或蛋白質(zhì)的標(biāo)識(shí)符，GO術(shù)語(yǔ)標(biāo)識(shí)符，分類標(biāo)識(shí)符或證據(jù)碼。

該頁(yè)面還為您提供了不同的序列標(biāo)識(shí)符類型（例如UniProtKB，ENSEMBL，以RefSeq或MGI標(biāo)識(shí)符）之間的映射，并下載注釋數(shù)據(jù)的能力。

調(diào)查GO SLIMS

使用此選項(xiàng)找出QuickGO如何幫助您創(chuàng)建自己的GO苗條，或使用預(yù)定義的GO GO財(cái)團(tuán)以SLIMS產(chǎn)生本體結(jié)構(gòu)的具體意見，或注釋集。

查看GO歷史

使用此選項(xiàng)可以查看歷史的變遷中去，作為記錄在的UniProt-GOA數(shù)據(jù)庫(kù)。

在此頁(yè)面，您可以指定可選的過濾器來查看基于日期范圍的修改，規(guī)定的條件和/或改變的類型。

GO細(xì)長(zhǎng)型和GO期限比較 - 選擇條款 - 期限籃

本節(jié)將選擇條款頁(yè)面顯示你的任期籃子的內(nèi)容。

您可以通過點(diǎn)擊它添加一個(gè)詞來選擇術(shù)語(yǔ)列表

圖標(biāo); 您可以通過點(diǎn)擊添加所有的條款，以列表

的標(biāo)題行中的圖標(biāo)。

您可以通過點(diǎn)擊它添加一個(gè)詞來對(duì)比圖

按鈕。執(zhí)行此操作時(shí)，該條款將被添加到圖表和列表項(xiàng)將用來突出圖表中的術(shù)語(yǔ)相同的顏色突出顯示。此外，該

按鈕變?yōu)?img doc360img-src='http://image89.360doc.com/DownloadImg/2015/09/2414/59350520_5.png' src="http://image89.360doc.com/DownloadImg/2015/09/2414/59350520_5.png"/>; 點(diǎn)擊這個(gè)按鈕刪除從圖表中的術(shù)語(yǔ)。

您可以通過點(diǎn)擊添加所有的術(shù)語(yǔ)來對(duì)比圖

的標(biāo)題行中鍵。

GO細(xì)長(zhǎng)型和GO期限比較 - 編輯術(shù)語(yǔ) - 比較條款

本節(jié)編輯條款頁(yè)面顯示您所選擇的是你苗條的一部分GO術(shù)語(yǔ)列表。術(shù)語(yǔ)列表被劃分成三個(gè)部分，每個(gè)本體。

您可以通過點(diǎn)擊它從列表中刪除的項(xiàng)

按鈕。如果你點(diǎn)擊

了ontolgy標(biāo)題行中按鈕時(shí)，將刪除從列表中本體的所有條款。

您可以通過點(diǎn)擊它添加一個(gè)詞來對(duì)比圖

按鈕。執(zhí)行此操作時(shí)，該條款將被添加到圖表和列表項(xiàng)將用來突出圖表中的術(shù)語(yǔ)相同的顏色突出顯示。此外，該

按鈕變?yōu)?img doc360img-src='http://image89.360doc.com/DownloadImg/2015/09/2414/59350520_5.png' src="http://pubimage.360doc.com/wz/default.gif"/>; 點(diǎn)擊這個(gè)按鈕刪除從圖表中的術(shù)語(yǔ)。

您可以從本體通過單擊添加所有條款

的本體標(biāo)題行的按鈕。

關(guān)系類型

IS_A

項(xiàng)A is_a項(xiàng)B指這個(gè)詞一個(gè)詞是B的子類型
。例如，“轉(zhuǎn)錄”是一種“核酸代謝過程”中。

部分

項(xiàng)A part_of項(xiàng)B指短期A始終是長(zhǎng)期B的一部分
。例如，“轉(zhuǎn)錄”始終是“基因的表達(dá)”的一部分。

調(diào)控

項(xiàng)A規(guī)定條件B指這個(gè)詞一個(gè)調(diào)節(jié)項(xiàng)B，但項(xiàng)B可能并不總是被長(zhǎng)期A.調(diào)節(jié)

POSITIVELY_REGULATES

一個(gè)子關(guān)系的“調(diào)整對(duì)象”的關(guān)系。
期限一positively_regulates項(xiàng)B指項(xiàng)B正由長(zhǎng)期A.調(diào)節(jié)

NEGATIVELY_REGULATES

一個(gè)子關(guān)系的“調(diào)整對(duì)象”的關(guān)系。
期限一negatively_regulates項(xiàng)B指長(zhǎng)期B的負(fù)面長(zhǎng)期A.調(diào)節(jié)

HAS_PART

has_part意味著項(xiàng)B總是有，因?yàn)樗L(zhǎng)期A的一部分，但長(zhǎng)期A可獨(dú)立存在長(zhǎng)期B的
。例如，“蛋白質(zhì)結(jié)合trancription活性因子”總是作為它的一部分“蛋白結(jié)合”，而是“蛋白結(jié)合”可以獨(dú)立地發(fā)生的轉(zhuǎn)錄因子的活性。
另外，has_part不是過渡關(guān)系，意思是有否暗示基因產(chǎn)物注釋以術(shù)語(yǔ)A可能還與術(shù)語(yǔ)B或它的任何父詞條正確相關(guān)聯(lián)
。Has_part 應(yīng)讀入相反的方向上的其他關(guān)系。

OCCURS_IN

文件即將更新...

數(shù)據(jù)下載格式

下載格式

已創(chuàng)建的過濾注釋集可以從QuickGO以多種格式被下載（見'制表符分隔值'下面為用戶指定的下載格式）。

基因協(xié)會(huì)文件（GAF 2.0）
由GO聯(lián)盟用于批注文件的主要格式。字段都在17列制表符分隔的格式提供。該GAF2.0格式規(guī)范描述如下：http://www./GO.format.gaf-2_0.shtml
Gene2GO
使用7制表符分隔領(lǐng)域提供“分類群”的文件格式，“基因產(chǎn)品ID”，“證據(jù)”，“資格賽”，“GO術(shù)語(yǔ)名稱”，“參考”和“看點(diǎn)”的信息。
ProteinList
獨(dú)特的蛋白質(zhì)的制表符分隔的列表，如顯示在選擇的注釋組的“基因產(chǎn)品ID”字段。輸出包含特定蛋白質(zhì)的描述：數(shù)據(jù)庫(kù)（DB），標(biāo)識(shí)（ID），符號(hào)，名稱，別名，類型和分類群。NB的同義詞領(lǐng)域包括同義蛋白或基因的名稱或符號(hào)，國(guó)際蛋白指數(shù)標(biāo)識(shí)符以及二次UniProtKB的加入。
FASTA
一個(gè)FASTA格式的輸出，提供UniProt登錄，符號(hào)，蛋白質(zhì)名稱和所選擇的蛋白質(zhì)的蛋白質(zhì)序列。
制表符分隔值
制表符分隔格式，反映了QuickGO蛋白質(zhì)注解表中選擇的列。默認(rèn)的表顯示可以通過增加或減少使用中的“顯示”彈出窗口中提供的選項(xiàng)列被改變。

“有了'弦

附：Not_supplied

該GO協(xié)會(huì)的指導(dǎo)方針上采用了推斷的序列相似性（ISS）的證據(jù)代碼的建議“與”字段中填充了一個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù)標(biāo)識(shí)符，
凡“與”字段中填入“附：Not_supplied”，注釋組創(chuàng)建注釋沒有為這個(gè)領(lǐng)域的任何條目。

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從GO術(shù)語(yǔ)關(guān)鍵字搜索返回的檢索GO術(shù)語(yǔ)列表時(shí)列的說明顯示

GO本體

GO術(shù)語(yǔ)標(biāo)識(shí)符

GO術(shù)語(yǔ)名稱

過時(shí)的標(biāo)簽

定義或同義詞標(biāo)簽

從蛋白質(zhì)的關(guān)鍵字搜索返回的檢索到的蛋白質(zhì)列表時(shí)列的說明顯示

UniProtKB加入

基因符號(hào)

分類

蛋白質(zhì)名稱

該值的GO術(shù)語(yǔ)的詳細(xì)信息頁(yè)面說明

定義

注解

二級(jí)標(biāo)識(shí)

GONUTS頁(yè)

同義詞

外部參照

祖圖

祖先表

關(guān)系的關(guān)鍵

兒童條款

蛋白注釋

統(tǒng)計(jì)

列在表中注釋的描述

數(shù)據(jù)庫(kù)

基因產(chǎn)品編號(hào)

產(chǎn)品形態(tài)ID

符

預(yù)選賽

GO標(biāo)識(shí)

原GO ID

參考

佐證

隨著

方面

命名

代名詞

類型

分類群

分類群名稱

迄今

分配人

GO術(shù)語(yǔ)名稱

原GO術(shù)語(yǔ)名稱

次序

列在長(zhǎng)期的歷史/更改日志說明

時(shí)間戳

GO ID

GO術(shù)語(yǔ)名稱

行為

分類

詳細(xì)信息

預(yù)選賽

在不預(yù)選賽

該Contributes_to預(yù)選賽

該Colocalizes_with預(yù)選賽

GO參考

GO_REF：0000002

GO_REF：0000003

GO_REF：0000004

GO_REF：0000015

GO_REF：0000019

GO_REF：0000020

GO_REF：0000023

GO_REF：0000033

證據(jù)法

EXP

IDA

IPI