首先簡(jiǎn)單介紹一下BioRxiv: 它由非營(yíng)利的研究和教育機(jī)構(gòu)冷泉港實(shí)驗(yàn)室在2013年發(fā)起并運(yùn)維，將其作為一種促進(jìn)學(xué)術(shù)交流的方法，目前只接收英文手稿。由于不需要同行評(píng)審，所以耗時(shí)短。只要你的文章通過(guò)了攻擊性和/或非科學(xué)性、剽竊抄襲等基本篩查即可發(fā)表。BioRxiv不是雜志，所以沒(méi)有影響因子。當(dāng)你將手稿提交到BioRxiv后，你可以收到同行的反饋意見(jiàn)。手稿可以在提交雜志之前或雜志評(píng)審階段發(fā)布在BioRxiv上，但如果已被雜志接收，則不應(yīng)發(fā)布。在期刊正式接受文章之前，作者可以隨時(shí)通過(guò)點(diǎn)擊作者區(qū)域內(nèi)的“提交修訂”來(lái)提交文章的修訂版本。一旦發(fā)布到biorxiv上，文章就可以引用，因此無(wú)法刪除。

BioRxiv有如下幾點(diǎn)優(yōu)勢(shì)：1）可以盡早地公開(kāi)自己的發(fā)現(xiàn)，當(dāng)你的手稿在線發(fā)表在BioRxiv后，BioRxiv會(huì)顯示發(fā)表時(shí)間，這可以避免以下尷尬：在這漫長(zhǎng)的投稿-發(fā)表過(guò)程中，你的競(jìng)爭(zhēng)者捷足先登，在雜志上發(fā)表了和你類(lèi)似的發(fā)現(xiàn)，這可能會(huì)打亂你原來(lái)的發(fā)表計(jì)劃，轉(zhuǎn)投其他雜志，或者再補(bǔ)充新的數(shù)據(jù)超越前者。而B(niǎo)ioRxiv因?yàn)槠鋾r(shí)效快，48小時(shí)內(nèi)即可顯示，可以作為先后順序的證據(jù)，或引導(dǎo)你和競(jìng)爭(zhēng)者背靠背發(fā)表。2）發(fā)表在BioRxiv上的文章也可以作為申請(qǐng)基金或者崗位的籌碼，大多數(shù)研究資助者開(kāi)始將預(yù)印本“合法化”。目前，英國(guó)醫(yī)學(xué)研究理事會(huì)、NIH以及霍華德·休斯醫(yī)學(xué)研究所都鼓勵(lì)受資助者在基金申請(qǐng)書(shū)中引用預(yù)印本，而不只是經(jīng)過(guò)同行評(píng)議的論文。陳和扎克伯格基金會(huì)（CZI）甚至要求受資助者在論文被提交給期刊的同時(shí)發(fā)表預(yù)印本。

作為當(dāng)下生物領(lǐng)域最大的預(yù)印本發(fā)行服務(wù)，BioRxiv的流行度如何呢？哪個(gè)專(zhuān)業(yè)的文章發(fā)表最多呢？發(fā)表在BioRxiv上的文章最終發(fā)表在哪些雜志上了？這些文章的引用率和下載量如何呢？明尼蘇達(dá)大學(xué)的Ran Blekhman 和Richard J.Abdill就這些問(wèn)題對(duì)2013-2018年11月的37,648篇文章進(jìn)行了數(shù)據(jù)分析，他們發(fā)現(xiàn)發(fā)表在BioRxiv的文章量呈逐年逐月遞增趨勢(shì)（圖1a），下載量也成遞增趨勢(shì)（圖1b），同時(shí)選擇發(fā)表在BioRxiv的作者數(shù)目也在增加（圖1c）。其中2018年投稿數(shù)目為18,825，比之前四年的總合還多，這里面神經(jīng)科學(xué)和生物信息學(xué)方向的文章數(shù)目和比重最高，分占一二席。單2018年10月就有2,000投稿量。下載量方面，單篇文章的下載量中位數(shù)是279，其中基因組學(xué)的單篇下載量中位數(shù)最高，為496，但由于神經(jīng)科學(xué)文章量最多，使其在下載總量方面于2018年10月首次超過(guò)生物信息學(xué)。目前已有十萬(wàn)六千多作者在BioRxiv上投稿，2018年新增了84,000作者。這些數(shù)據(jù)都顯示 BioRxiv越來(lái)越被認(rèn)可。 

圖1.BioRxiv的累積投稿量、下載量及投稿作者數(shù)目。a)投稿量的整體趨勢(shì)。b) 總下載量的整體趨勢(shì)。c)每年向BioRxiv投稿的新增作者數(shù)及總作者數(shù)。

那么這些預(yù)印本手稿的發(fā)表情況如何呢？如果手稿已發(fā)表在雜志上，BioRxiv網(wǎng)站會(huì)在文章題目下方給出手稿發(fā)表雜志的鏈接，參照這一數(shù)據(jù)，迄今為止已有42%的文章被發(fā)表。其中進(jìn)化生物學(xué)發(fā)表率最高，神經(jīng)科學(xué)發(fā)表數(shù)目最多（圖2）。不過(guò)這一統(tǒng)計(jì)結(jié)果有個(gè)小問(wèn)題，因?yàn)橛行╊A(yù)印本在發(fā)表過(guò)程中改變了名稱(chēng)，所以實(shí)際上這一數(shù)據(jù)更高，并且2017年以前上傳的預(yù)印本發(fā)表率基本上在60%以上， 2018年的發(fā)表率約為20%，拉低了平均水平，但也可以理解，畢竟2018年新上傳的手稿需要足夠時(shí)間發(fā)表。

 圖2. 不同專(zhuān)業(yè)領(lǐng)域預(yù)印本發(fā)表的比例（b）和數(shù)目（c）

另一個(gè)大家比較關(guān)注的問(wèn)題是：預(yù)印本都去哪兒了？發(fā)表在什么雜志上了呢？數(shù)據(jù)顯示這些文章最終發(fā)表在1,531種不同雜志上，其中Scientific Reports 發(fā)表了最多（828），其次是elife(750)和PLOS ONE（741）(圖3)。雖然數(shù)目不多，還是有預(yù)印本發(fā)在高影響因子雜志上，如：至2018年11月，已有35篇文章發(fā)表在Cell上。那么這些文章的發(fā)表周期如何呢？作者統(tǒng)計(jì)了從預(yù)印本上傳日期和雜志發(fā)表日期的時(shí)間間隔，發(fā)現(xiàn)發(fā)表周期中位數(shù)是5.5個(gè)月，75%的雜志能在8個(gè)月內(nèi)發(fā)表，90%的雜志能在一年內(nèi)發(fā)表，而最長(zhǎng)記錄是三年七個(gè)月。Nature Genetics的中位發(fā)表周期最長(zhǎng)，約9個(gè)月；G3雜志最短，約4個(gè)月。

圖3.預(yù)印本的雜志發(fā)表情況：發(fā)表在Scientific Reports、elife、PLOS One雜志上的預(yù)印本數(shù)目最多

預(yù)印本的下載量可以表征該預(yù)印本的受關(guān)注程度。作者結(jié)合雜志影響因子和預(yù)印本下載量發(fā)現(xiàn)，高下載量的文章通常也發(fā)表在高影響因子雜志上，具有較高的正相關(guān)性（圖4）。發(fā)表在Nature Methods和Nature Genetics雜志上的預(yù)印本單篇下載量最高，而PLOS ONE上單篇下載量最低.

圖4.發(fā)表在不同雜志上的預(yù)印本的單篇文章下載量。中間框顯示雜志影響因子與其預(yù)印本中位下載量的關(guān)系。

最后作者安利了他們自己設(shè)計(jì)的Rxivist網(wǎng)站：https:///。其最大優(yōu)勢(shì)是幫讀者篩選和過(guò)濾感興趣的或最受關(guān)注的文章。基于Twitter轉(zhuǎn)載量和總下載量了解興趣領(lǐng)域近期（Twitter）或一段時(shí)間內(nèi)（總下載量）最受關(guān)注的預(yù)印本。