無(wú)縫克隆是將目的片段按照一定方向拼接到線性化載體上的一種基因克隆方法,目的片段可以是一個(gè)或多個(gè),載體線性化可使用酶切或者PCR的方式。使用這種方法進(jìn)行載體構(gòu)建時(shí),不局限于酶切位點(diǎn),且可以連接幾個(gè)片段到載體上,故相對(duì)于傳統(tǒng)酶切連接載體構(gòu)建的方法,無(wú)縫克隆更為簡(jiǎn)單、快速、省時(shí)、省力。 完成無(wú)縫克隆,引物設(shè)計(jì)必不可少!全式金無(wú)縫克隆引物軟件帶您體驗(yàn)5分鐘完成引物設(shè)計(jì),配合無(wú)縫克隆試劑盒,輕松愉快完成無(wú)縫克隆。 按照下圖所示的操作流程,就可以登錄進(jìn)入無(wú)縫克隆在線設(shè)計(jì)軟件了。 根據(jù)實(shí)驗(yàn)需求,對(duì)載體的線性化方式進(jìn)行選擇:?jiǎn)蚊盖?、雙酶切和PCR擴(kuò)增,選擇不同的標(biāo)簽,下面的內(nèi)容會(huì)有所不同。 (1)選擇單酶切線性化; (2)將載體序列粘貼到相應(yīng)的位置。這里要注意,一定要保證所選的酶切位點(diǎn)在我們所輸入的載體序列上是完整的,否則可能不能識(shí)別;
(3)在選擇酶切位點(diǎn)之前,要確定進(jìn)行無(wú)縫克隆時(shí),是否需要保留線性化載體時(shí)所用的酶切位點(diǎn),可以根據(jù)需要進(jìn)行選擇;
(4)選擇我們線性化載體時(shí)所用的內(nèi)切酶,直接點(diǎn)擊就可以彈出下拉菜單,選擇相應(yīng)的內(nèi)切酶即可;
(5)選擇需要插入片段的個(gè)數(shù),最多可以選擇5個(gè); (6)將插入片段序列粘貼到“插入DNA片段”下方的方框中; (7)點(diǎn)擊下方的“生成引物”即可得到您無(wú)縫克隆所需要的引物; (8)下圖就是生成的引物序列,將這個(gè)序列復(fù)制下來(lái)就是您的無(wú)縫克隆引物了。 了解了單酶切線性化載體的無(wú)縫克隆引物設(shè)計(jì)操作方法,是不是覺(jué)得很簡(jiǎn)單? 下面來(lái)看一下雙酶切線性化載體的無(wú)縫克隆引物設(shè)計(jì)操作方法,與單酶切的方法很相似。 (1)選擇雙酶切線性化; 第(2)(3)步與單酶切線性化載體的操作步驟相同。 (4)選擇線性化載體所用的兩個(gè)內(nèi)切酶; 其余的步驟跟單酶切線性化完全一樣,不再贅述。 PCR擴(kuò)增線性化的載體的引物設(shè)計(jì)與前面兩種稍有不同。 (1)選擇PCR擴(kuò)增線性化; (2)在下方的兩個(gè)方框中分別輸入克隆位點(diǎn)上游序列和克隆位點(diǎn)下游序列,上下游每個(gè)至少要20個(gè)堿基;
(3)選擇需要插入片段的個(gè)數(shù),最多可以選擇5個(gè); (4)將我們的插入片段序列粘貼到“插入DNA片段”下方的方框中; (5)點(diǎn)擊下方的“生成引物”即可得到您無(wú)縫克隆所需要的引物(圖片展示可參考單酶切線性化、雙酶切線性化載體操作步驟)。 相關(guān)產(chǎn)品推薦: 以上是本期為您介紹的無(wú)縫克隆在線引物設(shè)計(jì)軟件使用指南,希望對(duì)您的實(shí)驗(yàn)所有幫助,下期見(jiàn)! |
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