本文今年2月底發(fā)表在Nature上，該研究通過對復(fù)旦大學(xué)附屬中山醫(yī)院手術(shù)切除的肝細(xì)胞癌及配對癌旁組織進(jìn)行蛋白組學(xué)和磷酸組學(xué)分析，提出早期肝細(xì)胞癌的蛋白質(zhì)組學(xué)分層方法，并發(fā)現(xiàn)一種稱作甾醇O-酰基轉(zhuǎn)移酶1（SOAT1）其表達(dá)水平與肝癌患者較差的預(yù)后密切相關(guān)。團(tuán)隊隨后在中山醫(yī)院254例肝癌組織芯片中進(jìn)一步驗證：SOAT1的表達(dá)水平與肝癌患者的總體生存時間顯著相關(guān)，多因素分析顯示SOAT1是早期肝癌患者的獨立預(yù)后因素。為了進(jìn)一步挖掘SOAT1的臨床價值，利用中山醫(yī)院肝外科構(gòu)建的PDX模型進(jìn)行了SOAT1抑制劑——阿伐麥布（avasimibe）的藥效學(xué)研究。以往該抑制劑作為一種治療動脈粥樣硬化藥物進(jìn)行臨床試驗，還從未發(fā)現(xiàn)其抗肝癌作用。研究團(tuán)隊發(fā)現(xiàn)，阿伐麥布能夠顯著抑制SOAT1高表達(dá)PDX模型的腫瘤大小，且未觀察到明顯毒副作用。該臨床前研究結(jié)果顯示，阿伐麥布有望成為肝癌靶向治療中的一種新型藥物，在肝癌藥物治療中發(fā)揮重要作用。上述成果發(fā)現(xiàn)了肝癌精準(zhǔn)治療新靶點，開啟了蛋白質(zhì)組學(xué)驅(qū)動的精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)新篇章。

本文采取多種類型檢測手段（靶向性質(zhì)譜和高靈敏度ELISA）相結(jié)合的方式，研究者對大量臨床組織樣品的定量分析發(fā)現(xiàn)LIF在胰腺腫瘤組織中特異性高表達(dá)，并且與其他常見實體瘤相比，LIF的癌特異性高表達(dá)具有明顯的胰腺癌特異性。相關(guān)性分析表明，LIF在胰腺腫瘤組織中的表達(dá)量與病人的病理狀況，特別是分化狀態(tài)及生存期緊密相關(guān)。同時，病人血液中的LIF變化水平與藥理反應(yīng)的病理分析結(jié)果高度一致，由此證明其作為胰腺癌生物標(biāo)志物的可行性。在實現(xiàn)對胰腺癌的診斷之外，他們還發(fā)現(xiàn)，LIF蛋白是一個治療胰腺癌的全新的藥物靶點。由于晚期胰腺癌對化療藥物有很強(qiáng)的耐受性，而且對放射治療不敏感，目前胰腺癌的治療效果都難盡如人意。而LIF蛋白的發(fā)現(xiàn)，將有望破解胰腺癌的治療困境，為胰腺癌病人帶去生存的希望。

5月2日，又一篇卵巢癌新靶點的文章在nature上重磅發(fā)表！！還是那個蛋白質(zhì)組，卻是腫瘤領(lǐng)域又一重要新發(fā)現(xiàn)！腫瘤轉(zhuǎn)移一直是困擾癌癥治療的一大問題。5月2日，來自芝加哥大學(xué)的Ernst Lengyel研究團(tuán)隊在頂級期刊Nature在線發(fā)表了題為“Proteomics reveals NNMT as a master metabolic regulator of cancer-associated fibroblasts”的研究。

研究人員利用蛋白質(zhì)組分析，找到了介導(dǎo)卵巢癌轉(zhuǎn)移的“幫兇”--- NNMT（nicotinamide N-methyltransferase），而該關(guān)鍵靶標(biāo)蛋白有望成為抑制卵巢癌細(xì)胞轉(zhuǎn)移的干預(yù)靶點。

2019年5月2日，Cell雜志報道了美國休斯敦貝勒醫(yī)學(xué)院研究人員利用基因、轉(zhuǎn)錄、蛋白及翻譯后修飾等多組學(xué)技術(shù)，對結(jié)腸癌/癌旁組織進(jìn)行了系統(tǒng)、全面的分析，整合多組學(xué)結(jié)果為后續(xù)癌癥治療方案提供了新思路，同時也為生物標(biāo)志物篩選、藥物靶點、分子分型等研究工作奠定理論基礎(chǔ)。作者對110例結(jié)腸癌腫瘤患者的癌組織和癌旁組織使用全外顯子組測序 (WXS)、基因組測序、RNA測序、microRNA測序、蛋白質(zhì)組學(xué)以及磷酸化蛋白質(zhì)組學(xué)等方法進(jìn)行全面系統(tǒng)的分析。通過比較多組學(xué)數(shù)據(jù)結(jié)果發(fā)現(xiàn)Label-free蛋白質(zhì)組學(xué)對基因功能的預(yù)測能力高于RNA測序分析，TMT蛋白質(zhì)組學(xué)更優(yōu)于前兩種，并突出蛋白質(zhì)組學(xué)研究基因功能的優(yōu)越性。

本文報道了年輕人群中彌漫型胃癌(GCs)的蛋白質(zhì)組學(xué)分析。磷酸化蛋白質(zhì)組的數(shù)據(jù)闡明了與體細(xì)胞突變相關(guān)的信號通路，基于突變-磷酸化的相關(guān)性。mRNA和蛋白豐度之間的相關(guān)性提供了潛在的癌基因和與患者生存相關(guān)的腫瘤抑制因子。此外，通過對mRNA、蛋白質(zhì)、磷酸化和N-糖基化數(shù)據(jù)的綜合聚類分析，確定了彌漫性GCs的四種亞型。利用蛋白質(zhì)組學(xué)數(shù)據(jù)可以區(qū)分這些亞型。四種亞型分別與增殖、免疫應(yīng)答、代謝和侵襲相關(guān)，主要通過磷酸化和N-糖基化數(shù)據(jù)確定與免疫和侵襲相關(guān)的通路。因此，我們的蛋白質(zhì)組學(xué)分析除了基因組分析之外，還提供了更多的信息，這可以提高對彌漫性GCs中癌癥患者分型的了解。