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      淺談CNV

       生物_醫(yī)藥_科研 2019-09-05

      1

      CNV的定義

      CNV(Copy number variation,拷貝數(shù)變異)是人類遺傳病的一大重要原因, CNV是由基因組發(fā)生重排而導(dǎo)致的,一般指長(zhǎng)度為1kb以上的基因組大片段拷貝數(shù)的增加或減少,主要表現(xiàn)為亞顯微水平的缺失或重復(fù)。

      圖1 CNV變異的遺傳學(xué)分類

      圖2 CNV在基因組中的存在形式

      2

      CNV的形成機(jī)制

      1)非等位同源重組(NAHR):由兩條同源的、但在基因組不同位置重復(fù)出現(xiàn)的、高度相似性的DNA序列配對(duì)并發(fā)生序列交換造成的。

      圖3 非等位同源重組(NAHR)

      2)非等位同源末端連接(NHEJ):可以發(fā)生在細(xì)胞周期的各個(gè)時(shí)相,為DNA雙鏈斷裂的修復(fù)機(jī)制,產(chǎn)生一些結(jié)構(gòu)簡(jiǎn)單的CNV。

      非同源末端連接,是真核細(xì)胞雙鏈DNA斷裂時(shí)的修復(fù)機(jī)制。生理性的、病理性的DNA雙鏈斷裂都使用這一修復(fù)機(jī)制,同時(shí)現(xiàn)研究也認(rèn)為NHEJ為腫瘤病人產(chǎn)生染色體易位畸變的主要機(jī)制。

      圖4 非等位同源末端連接(NHEJ)

      3)復(fù)制叉停滯和模板轉(zhuǎn)換(Fos Tes):基于DNA復(fù)制過程的復(fù)制錯(cuò)誤機(jī)制,產(chǎn)生含復(fù)雜結(jié)構(gòu)的CNV。

      當(dāng)DNA復(fù)制叉停滯時(shí),滯后鏈可從模板上脫落,通過微同源序列轉(zhuǎn)到另一個(gè)復(fù)制叉上重新開始合成DNA。產(chǎn)生模板轉(zhuǎn)換的兩個(gè)復(fù)制叉在空間位置上會(huì)彼此接近,新的復(fù)制叉可以在起始復(fù)制叉的上游也可以是下游。

      圖5 復(fù)制叉停滯和模板轉(zhuǎn)換(Fos Tes)

      3

      CNV的致病機(jī)制

      圖6 CNV的致病機(jī)制匯總

      4

      CNV與人類疾病

      2004年CNV被首次發(fā)現(xiàn)導(dǎo)致出生缺陷等重大疾病,預(yù)測(cè)CNV與15%的人類遺傳病相關(guān)聯(lián)。

      圖7 CNV的概況

      安諾優(yōu)達(dá)CNV檢測(cè)體系

      產(chǎn)前篩查——無(wú)創(chuàng)優(yōu)+2.0

      無(wú)創(chuàng)優(yōu)+(2.0)是指在現(xiàn)有NIPT檢測(cè)技術(shù)基礎(chǔ)之上,通過無(wú)創(chuàng)方式檢測(cè)出更多的染色體缺失重復(fù)疾病。包括常見3種常見胎兒染色體非整倍體疾病、4種性染色體非整倍體疾病、21種胎兒其他常染色體非整倍體疾病及103種大于3Mb的胎兒染色體缺失/重復(fù)(CNV)疾?。ü?31種目標(biāo)疾病全面覆蓋)。 

      產(chǎn)前診斷/成人兒童染色體檢測(cè)/自然流產(chǎn)物染色體檢測(cè)—NGS染色體異常檢測(cè)(CNV-seq)

      可檢測(cè)0.1M以上染色體缺失/重復(fù)(CNV),具有以下特點(diǎn):

      ·  高準(zhǔn)確率(vs 核型誤差)
      ·  高覆蓋率(vs FISH檢測(cè)范圍窄)
      ·  高分辨率(vs 核型分辨率低)
      ·  高成功率(vs 核型培養(yǎng)失?。?/strong>
      ·  可發(fā)現(xiàn)新的缺失/重復(fù)(vs 芯片)
      ·  價(jià)格相對(duì)低廉(vs CMA高價(jià))

      參考文獻(xiàn):

      Xie C, Tammi M T. CNV-seq, a new method to detect copy number variation using high-throughput sequencing[J]. BMC Bioinformatics, 2009, 10(1): 80-80.

      官  宣

      重磅消息!?。?/strong>

      安諾優(yōu)達(dá)旗下——安諾優(yōu)媽優(yōu)爸

      正式和大家見面啦

      生娃養(yǎng)娃不簡(jiǎn)單

      優(yōu)媽優(yōu)爸看過來(lái)

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