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      相關性矩陣熱圖繪制工具使用案例

       樹葉上的小螞 2020-01-04

      來給你一步一步操作一下:

      首先打開軟件,新版的SangerBox中有,如圖

      attachments-2018-06-QCe8IlmO5b211633d0843.png為了防止內(nèi)存不夠,我先將聚類和反轉(zhuǎn)這兩個復選框取消勾選,然后再導入一個表達譜文件:Merge_GPL1261.expro.txt

      attachments-2018-06-WXYp5pGI5b2116a6969b8.png

      這個時候我們可以看到他按列進行了相關系數(shù)計算,但都是紅色,因為他們的相關系數(shù)很高

      這個時候,我們可以換著設置一下最小值,和點擊顯示系數(shù)和聚類,如下圖

      attachments-2018-06-8lSbT2ko5b211793c99fb.png這里就很明顯這些樣本之間的相關性聚類,整體上分兩組。

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