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      ?線粒體代謝調(diào)控組織損傷修復(fù)不同階段中巨噬細(xì)胞功能轉(zhuǎn)換

       成靖 2021-11-23
      原創(chuàng)2021-11-22 09:38·代謝網(wǎng)
      線粒體代謝調(diào)控組織損傷修復(fù)不同階段中巨噬細(xì)胞功能轉(zhuǎn)換

      組織結(jié)構(gòu)和功能損傷修復(fù)是一個基本的生物學(xué)過程,是生命體生存所必需的。損傷修復(fù)分為兩個階段,促炎階段(抗菌防御)促修復(fù)階段(組織生長和分化)。在這個過程中,參與損傷修復(fù)的MΦ(wound MΦ, 傷口MΦ)需要應(yīng)對損傷組織的微環(huán)境并迅速調(diào)整狀態(tài)來行使其功能。具體來說,損傷發(fā)生后,外周血單核細(xì)胞被招募到損傷部位,激活為1型MΦ,1型MΦ具有促炎和促血管生成特征,參與微生物抵御、促進(jìn)組織血管化和受損組織的再生生長。在第二階段,MΦ激活為2型,促進(jìn)瘢痕形成和修復(fù)。然而,傷口MΦ從促炎1型到促修復(fù)2型轉(zhuǎn)變的分子調(diào)控機制仍不清楚。

      單核細(xì)胞/巨噬細(xì)胞(MΦ)是參與機體損傷修復(fù)的重要免疫細(xì)胞。一些研究(主要是體外研究)表明,在MΦ激活過程中伴隨著細(xì)胞代謝重編程。理解這個重編程過程會為促進(jìn)組織的修復(fù)、再生能力提供理論基礎(chǔ)。然而,在組織損傷修復(fù)過程中不同階段的MΦ的代謝重編程、信號調(diào)控、活化類型之間的關(guān)系仍不明確。

      最新研究

      2021年8月28日,來自科隆大學(xué)的Sabine A. Eming團隊在Cell Metabolism上發(fā)表了題為《Mitochondrial metabolism coordinates stage-specific repair processes in macrophages during wound healing》的文章,作者發(fā)現(xiàn)早期和晚期傷口MΦ在轉(zhuǎn)錄和代謝方面存在顯著差異,早期MΦ不僅需要糖酵解功能,還依賴線粒體產(chǎn)生的活性氧的來穩(wěn)定HIF-1α促進(jìn)促炎癥、促血管生長;晚期MΦ依賴于M2型信號-IL-4Ra受體-氧化磷酸化途徑增強修復(fù)功能。該發(fā)現(xiàn)揭示了愈傷過程中巨噬細(xì)胞代謝重編程的機制與意義,提供了促進(jìn)傷口MΦ功能的新靶點。

      線粒體代謝調(diào)控組織損傷修復(fù)不同階段中巨噬細(xì)胞功能轉(zhuǎn)換

      傷口MΦ在損傷早期和晚期呈現(xiàn)不同的代謝模式和基因表達(dá)模式

      為了研究傷口MΦ(CD45+CD11b+F4/80+細(xì)胞)在整個損傷修復(fù)期間的代謝特征,作者使用了C57BL/6野生型小鼠背部全層切除皮膚損傷模型,從炎癥早期(損傷后4天)和瘢痕形成晚期(損傷后14天)的創(chuàng)面組織中分離出MΦ。作者首先測定了細(xì)胞耗氧率(OCR)和基礎(chǔ)細(xì)胞外酸化率(ECAR),發(fā)現(xiàn)與早期傷口MΦ相比,晚期傷口MΦ有更高的基礎(chǔ)呼吸、ATP周轉(zhuǎn)率和剩余呼吸能力,并且糖酵解程度明顯較低。Mito-TrackerTM Green (MTG)熒光染色顯示,晚期MΦ中有更多的線粒體,這與其較高的OCR一致。綜上所述,早期和晚期的傷口MΦ能量代謝特征有顯著差異,晚期MΦ較高的氧氣消耗可能是由于線粒體重量增加和OXPHOS上調(diào)引起的。

      那么代謝模式重編程是由轉(zhuǎn)錄組的重編程引起的嗎?RNA-seq結(jié)果提示愈傷早期和晚期MΦ的基因表達(dá)譜有顯著的差異,在早期MΦ中促炎相關(guān)基因(Nos2和Ptgs2)和促血管生成(Vegfa)基因高表達(dá),在晚期MΦ中2型細(xì)胞因子相關(guān)基因 (Ccl22、Ear2 Irf4, Mgll, Mgl2, Mrc1和Retnla)高表達(dá)。

      通路富集的結(jié)果與兩種MΦ代謝模式也是一致的:早期MΦ表現(xiàn)出糖酵解/糖異生和HIF-1信號相關(guān)基因和通路的富集,和線粒體相關(guān)的代謝過程有血紅素代謝、檸檬酸代謝和琥珀酸代謝;而晚期MΦ在2型細(xì)胞因子誘導(dǎo)的途徑中富集,表現(xiàn)出更高的脂肪攝取和分解代謝,和線粒體相關(guān)的代謝過程有肉堿代謝、線粒體蛋白質(zhì)翻譯的tRNA氨基?;?、ATP運輸和線粒體DNA復(fù)制。上述結(jié)果表明傷口MΦ在早期和晚期有不同的基因表達(dá)模式和代謝模式。

      線粒體代謝調(diào)控組織損傷修復(fù)不同階段中巨噬細(xì)胞功能轉(zhuǎn)換

      傷口MΦ的亞群異質(zhì)性

      為了進(jìn)一步解析不同時期傷口MΦ中基因表達(dá)和代謝模式的異質(zhì)性,作者對早期和晚期傷口MΦ進(jìn)行了單細(xì)胞測序(scRNA-seq)分析。結(jié)果顯示MΦ可以分為7個群。早期MΦ以2群和3群為主,而晚期MΦ以0群、1群和6群為主,這提示MΦ的細(xì)胞類型在傷口愈合的不同時期存在異質(zhì)性。對各個群中早期、晚期傷口MΦ做特征評分發(fā)現(xiàn),同一個群中早期MΦ細(xì)胞的M1和糖酵解特征評分更高,晚期MΦ細(xì)胞的M2和OXPHOS特征評分更高,這與RNA-seq的結(jié)果是一致的,表明傷口愈合過程中MΦ從M1/糖酵解型向M2氧化型MΦ轉(zhuǎn)變。

      線粒體代謝調(diào)控組織損傷修復(fù)不同階段中巨噬細(xì)胞功能轉(zhuǎn)換

      損傷早期,線粒體呼吸鏈調(diào)控MΦ的促炎、促血管生成功能

      線粒體呼吸鏈(MRC)在調(diào)控MΦ極化的代謝重編程中發(fā)揮重要作用。那么,在傷口愈合過程中MRC如何調(diào)節(jié)傷口MΦ的極化呢?

      有研究報道,Dars2基因編碼線粒體天冬氨酸-tRNA合成酶2,是調(diào)控線粒體內(nèi)的呼吸鏈相關(guān)蛋白質(zhì)合成的關(guān)鍵基因。作者通過條件性敲除Dars2構(gòu)建了髓系細(xì)胞MRC失活的小鼠模型。作者用LPS+IFN-g處理骨髓來源的巨噬細(xì)胞(BMDM )[M(LPS + IFN-g)],發(fā)現(xiàn)LPS+IFN-g顯著誘導(dǎo)了WT BMDM中促炎因子基因(Il1b, Il6和Tnfa)的表達(dá),而在Dars2 KO 的BMDM中促炎因子變化不顯著。此外,Retnla、Arg1和Chil3在用IL-4 + IL-13處理BMDM [M(IL-4 + IL-13)]誘導(dǎo)的WT BMDM中顯著升高、在Dars2 KO BMDM中變化不顯著。這些發(fā)現(xiàn)表明在體外Dars2調(diào)控BMDM的促炎、促修復(fù)表型極化。

      那么,MRC失活會影響傷口MΦ的體內(nèi)修復(fù)功能嗎?作者發(fā)現(xiàn),與WT 小鼠相比,Dars2 MKO 小鼠的MΦ中NDUFB8 (CI)的蛋白水平顯著減少、UQCRC2 (CIII)和COX1 (CIV)的蛋白水平有一定程度的減少,這表明Dars2 KO MΦ確實發(fā)生了MRC缺陷。接下來,作者分析了Dars2 MKO小鼠的傷口愈合和組織恢復(fù)能力是否受到了影響。組織形態(tài)學(xué)分析顯示,與對照組小鼠相比,Dars2 MKO小鼠的傷口閉合顯著延遲,存在肉芽組織顯著減少、結(jié)痂脫落延遲和早期創(chuàng)面血管化顯著減少等特征,表明MRC失活會削弱傷口MΦ的體內(nèi)修復(fù)功能。有趣的是,Dars2 MKO小鼠在第4天和14天時創(chuàng)面MΦ數(shù)量和WT小鼠相當(dāng)。這表明MRC缺陷并未影響血液單核細(xì)胞招募到損傷部位。

      那么MRC影響傷口MΦ功能的機制是什么?髓系細(xì)胞中HIF-1α介導(dǎo)表達(dá)的VEGFA是組織修復(fù)中促血管生成的關(guān)鍵細(xì)胞因子,前期RNA-seq結(jié)果提示VEGFA在早期MΦ中高表達(dá)。作者進(jìn)一步發(fā)現(xiàn)早期Dars2 MKO小鼠的MΦ中HIF-1α靶基因水平表達(dá)顯著降低(包括Vegfa、糖酵解和促炎基因),提示HIF-1α通路可能參與了MRC對MΦ功能的調(diào)控。

      線粒體代謝調(diào)控組織損傷修復(fù)不同階段中巨噬細(xì)胞功能轉(zhuǎn)換

      早期MΦ通過MRC產(chǎn)生ROS來穩(wěn)定HIF-1α以促進(jìn)血管生成

      先前有研究發(fā)現(xiàn),用LPS處理BMDM時,線粒體膜電位(MMP)增加,MRC的功能從產(chǎn)生ATP轉(zhuǎn)向琥珀酸氧化,兩者提供了反向電子傳遞的驅(qū)動力,琥珀酸氧化導(dǎo)致ROS產(chǎn)生從而促進(jìn)HIF-1α的穩(wěn)定和Il1b的表達(dá)。

      作者首先利用四甲基羅丹明甲酯(TMRM)染色和流式檢測分析了WT和Dars2 MKO 小鼠的BMDM的MMP,發(fā)現(xiàn)空白處理時,WT和Dars2 KO BMDM的MMP相似,但是LPS刺激時,WT和Dars2 MKO MΦ中MMP增加程度也相當(dāng),表明Dars2 MKO 不影響B(tài)MDM MMP變化。

      接下來,作者用MitoSOX染色評估細(xì)胞mtROS的產(chǎn)生,LPS刺激后,WT BMDM 中MitoSOX+細(xì)胞比例比空白對照增加了約2.6倍,而Dars2 KO BMDM中MitoSOX+細(xì)胞比例顯著低于WT BMDM。檢測過氧化物清除基因發(fā)現(xiàn),在體外Dars2 KO BMDM(LPS+IFN-g)中和體內(nèi)Dars2 MKO小鼠早期傷口MΦ中,Gclc、Gclm、Gsr和Sod2的表達(dá)顯著降低。這表明,Dars2敲除不影響B(tài)MDM中線粒體MMP但是顯著降低了線粒體產(chǎn)生mtROS的能力。

      那么mtROS產(chǎn)生能力的降低是MRC損傷引起的嗎?對HIF-1α又有什么影響?非變性凝膠電泳顯示,與WT BMDM相比,Dars2缺陷BMDM中CI、CIII和CIV嚴(yán)重受損,在LPS+琥珀酸處理時HIF-1α依然發(fā)生降解。這表明,Dars2 KO MΦ中的MRC功能受損導(dǎo)致mtROS產(chǎn)生能力降低,進(jìn)一步導(dǎo)致HIF-1α穩(wěn)定性降低,導(dǎo)致早期傷口MΦ促炎癥和促血管生成功能的減弱,進(jìn)而影響早期的損傷修復(fù)。

      早期MΦ產(chǎn)生mtROS的細(xì)胞亞群

      作者進(jìn)一步分析了scRNA-seq數(shù)據(jù)中每個亞群的血管生成特征評分,發(fā)現(xiàn)MΦ的血管生成評分在4 天和14 天時顯著增加;對單個亞群分析發(fā)現(xiàn),不同亞群的血管生成評分存在異質(zhì)性,第3亞群的血管生成評分最高。有趣的是,血管生成評分與OXPHOS評分呈負(fù)相關(guān),這表明愈傷相關(guān)的MΦ血管生成并不依賴于OXPHOS。

      接下來,作者分析了每個亞群中與mtROS產(chǎn)生、炎癥和血管生成相關(guān)基因的表達(dá)情況。在4天時,Il1b、Vegfa、Hif1a、Ldha和Slc2a1基因以及ROS清除基因Gclc、Gclm、Gsr、Sod2和Nfe2l2主要富集在0、2、3和5亞群中。值得注意的是,第3個亞群中Idh1下調(diào)、而Acod1上調(diào),這是M1樣MΦ的特征并且反映了第3個亞群中TCA循環(huán)的下調(diào)。綜上所述,第3個亞群可能是愈傷早期MΦ重編程線粒體代謝產(chǎn)生mtROS的細(xì)胞類型。

      線粒體代謝調(diào)控組織損傷修復(fù)不同階段中巨噬細(xì)胞功能轉(zhuǎn)換

      IL-4Ra誘導(dǎo)的線粒體生物發(fā)生和OXPHOS在2型MΦ活化中起重要作用

      那么在創(chuàng)傷修復(fù)晚期MRC有怎樣的功能呢?作者發(fā)現(xiàn),Dars2 MKO小鼠的晚期MΦ中MRC蛋白水平與早期MΦ沒有差異,但是晚期MΦ卻確實呈現(xiàn) 2型功能。與此同時,體外IL-4誘導(dǎo)M2型極化實驗中,Dars2缺陷BMDM的M2極化受損。這些結(jié)果提示,在體內(nèi),損傷修復(fù)后期Dars2 KO MΦ中可能存在MRC的代償機制。

      作者進(jìn)一步利用IL4在體誘導(dǎo)M2極化動物模型探索MRC功能及代償機制。IL-4c可誘導(dǎo)局部MΦ增殖和M2型激活,作者通過小鼠腹腔注射IL-4c刺激構(gòu)建2型免疫刺激模型,發(fā)現(xiàn)WT小鼠中IL-4c處理導(dǎo)致MΦ數(shù)量增加,而Dars2 MKO小鼠MΦ數(shù)量增加弱于WT小鼠。流式分選腹膜MΦ做免疫印跡分析顯示,生理鹽水處理的Dars 2 MKO小鼠的NDUFB8、UQCRC2、COX1蛋白水平比WT小鼠低,而IL-4c處理的Dars 2 MKO小鼠的OXPHOS亞基的蛋白水平比生理鹽水處理組顯著升高,并且IL-4c處理的WT小鼠和Dars2 MKO小鼠有相似的Retnla、Arg1和Chil3表達(dá)。這些結(jié)果表明,在Dars2 MKO小鼠的MΦ中M2型信號可能是通過IL-4-OXPHOS途徑激活了線粒體代償功能。

      為了證實在晚期傷口MΦ中OXPHOS受到IL-4信號調(diào)控,作者首先分析了IL-4+IL-13刺激的WT BMDM線粒體的量,與對照組相比,IL-4+IL-13刺激的BMDM中線粒體顯著增加,這表明M2型信號誘導(dǎo)了線粒體生物發(fā)生。

      接下來,作者使用MTG染色結(jié)合流式細(xì)胞術(shù)分析了髓系細(xì)胞IL-4ra缺陷的小鼠(IL4ra MKO)和WT小鼠損傷后14天時的MΦ,與WT相比,IL4ra MKO小鼠MΦ中線粒體顯著降低,這表明晚期傷口MΦ的線粒體生物發(fā)生依賴于IL-4Ra信號。那么,IL-4ra KO對晚期損傷口MΦ線粒體呼吸作用有何影響呢?OCR顯示,與WT相比IL-4ra MKO小鼠晚期傷口MΦ的基礎(chǔ)呼吸、ATP周轉(zhuǎn)和剩余呼吸能力顯著降低;ECAR顯示,從IL-4ra MKO小鼠的晚期傷口MΦ糖酵解率顯著降低。這表明,在晚期傷口MΦ中IL-4Ra介導(dǎo)了M2型信號誘導(dǎo)線粒體生物發(fā)生和OXPHOS

      線粒體代謝調(diào)控組織損傷修復(fù)不同階段中巨噬細(xì)胞功能轉(zhuǎn)換

      M2型信號通過抑制mitoISR參與Dars2 KO中 MRC功能損傷的代償

      前期有研究發(fā)現(xiàn),在非免疫細(xì)胞中,Dars2 KO引起的MRC功能損傷會誘導(dǎo)代償性應(yīng)激反應(yīng),特別是線粒體綜合應(yīng)激反應(yīng)(mitoISR),mitoISR的特征是ATF4介導(dǎo)的單碳和葉酸途徑、絲氨酸和脯氨酸分解代謝上調(diào)。那么,Dars2 KO 的BMDM是否發(fā)生了mitoISR?

      mitoISR參與M2型信號保護線粒體功能的代償機制嗎?作者發(fā)現(xiàn),與WT相比,Dars2 KO BMDM的全細(xì)胞裂解液中MRC亞基NDUFB8、UQCRC2和COX1的蛋白水平較低。值得注意的是,雖然IL-4 + IL-13刺激對WT細(xì)胞中的MRC蛋白水平?jīng)]有顯著影響,但是Dars2 KO MΦ中IL-4 + IL-13刺激增強了MRC亞基NDUFB8、UQCRC2、COX1和ATP5A 的穩(wěn)定性。這提示M2型信號增強了MRC亞基的穩(wěn)定性。RNA-seq分析顯示,與WT相比,Dars2 KO MΦ中驅(qū)動mitoISR的關(guān)鍵轉(zhuǎn)錄因子Atf4和Ddit3/Cho及其下游靶基因表達(dá)上調(diào)。IL-4+IL-13刺激消除了Ddit3/Chop的表達(dá)上調(diào)。這些結(jié)果表明,M2型信號可以減輕Dars2 KO對線粒體功能的負(fù)面影響。

      鑒于Dars2 KO上調(diào)Ddit3/Chop的表達(dá)以及IL-4+IL-13下調(diào)Ddit3/Chop的表達(dá),作者推測在傷口愈合的后期M2型信號可能減弱了mitoISR。qRT-PCR顯示,在WT和Dars2 KO小鼠的損傷后14天的傷口MΦ中,mitoISR特征性轉(zhuǎn)錄因子Atf4和Ddit3/Chop表達(dá)水平相當(dāng)。這表明,愈傷后期M2型信號通過抑制mitoISR保護線粒體。

      線粒體代謝調(diào)控組織損傷修復(fù)不同階段中巨噬細(xì)胞功能轉(zhuǎn)換

      總 結(jié)

      傷口愈合是一個高度協(xié)調(diào)的過程,單核/巨噬細(xì)胞是該過程的重要參與者,在促炎階段參與抗菌,在促修復(fù)階段參與組織重構(gòu)。免疫細(xì)胞的功能變化常常伴隨著代謝重編程,然而巨噬細(xì)胞在愈傷過程中的代謝重編程機制一直有待闡明。本文發(fā)現(xiàn)早期傷口MΦ具有M1/糖酵解特征,晚期傷口MΦ有M2/OXPHOS特征。早期傷口MΦ中,細(xì)胞通過糖酵解和MRC產(chǎn)生mtROS穩(wěn)定HIF-1α,促進(jìn)促炎和促血管生成基因的表達(dá);晚期傷口MΦ中,細(xì)胞受M2型信號通過IL-4ra-OXPHOS途徑進(jìn)行代謝重編程,促進(jìn)MΦ修復(fù)功能。該發(fā)現(xiàn)揭示了愈傷過程中的巨噬細(xì)胞代謝重編的調(diào)節(jié)機制,提供了增強傷口MΦ的新靶點。

      文/阿司匹林 SHMM

      責(zé)編/Jane

      原文鏈接:

      https:///10.1016/j.cmet.2021.10.004

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