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      Nature社論:頂刊上腫瘤研究50%以上結(jié)果不能重復的幕后真相!

       菌心說 2022-04-18

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      近期一項規(guī)模浩大的腫瘤生物學復現(xiàn)項目不盡人意。科學家們也嘗試找出原因,最近《自然》上就發(fā)表了相關(guān)社論,這項研究其實也和吃瓜科研群眾息息相關(guān),一起來看看幕后結(jié)果吧!

      (https:///articles/71601)

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      圖片來源:《自然》官網(wǎng)截圖

      復現(xiàn)計劃的提出
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      因為十余年前部分藥企發(fā)現(xiàn)無法重復許多腫瘤生物學論文中的結(jié)果,但并未指明是哪篇論文,也沒有確定復現(xiàn)的標準,所以十年前一家開放科學中心和Science Exchange公司組織了一項癌癥生物學 (RPCB) 結(jié)果復現(xiàn)計劃,目的在于檢測著名期刊中的高引用論文的結(jié)論是否可以復現(xiàn)。研究人員記錄了七種實驗結(jié)果或“效果”;其中五個可以量化??傮w而言,46%的結(jié)果復現(xiàn)是成功的,也就是說有54%的結(jié)果無法重復

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      圖片來源:https://www./articles/d41586-021-03736-4

      初步結(jié)果
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      最明確的發(fā)現(xiàn)之一是實驗性治療的效果(例如殺死癌細胞或縮小腫瘤),總體上比最初報道的低85%。可以說大部分腫瘤殺滅作用都沒辦法較好地重現(xiàn)。而且陰性結(jié)果往往更容易重復。出現(xiàn)這類現(xiàn)象可能有以下原因:①統(tǒng)計誤差;②原始研究或復現(xiàn)中的偏差;③復現(xiàn)者缺乏專業(yè)知識,無法重復研究的關(guān)鍵操作。該項目的時間也比預期長了五年多,只覆蓋原計劃的四分之一評估實驗。說明此類評估需要更多時間和精力。

      復現(xiàn)操作也困難重重。所選的 53 篇論文中沒有一篇包含足夠的細節(jié)讓研究人員可以重復實驗。因此,復現(xiàn)者必須聯(lián)系作者以獲取信息,例如注射了多少細胞、通過什么途徑或使用的準確試劑。這些細節(jié)甚至連作者也無法提供,因為這些信息沒有被記錄或?qū)嶒炇页蓡T已經(jīng)離開。三分之一的作者拒絕提供更多信息或沒有回應。此外,復現(xiàn)者還必須向原始作者(例如細胞系、質(zhì)?;蚰P蜕铮┧魅£P(guān)鍵試劑,因為他們無法購買或從倉庫中獲取。不過好在大約 69% 的作者愿意分享他們的試劑,也有助于推動整個計劃的實施。

      更棘手的是,在一個實驗室中有效的方法可能另一個實驗室中完全無效,這可能是因為實驗室的硬件差異或方法學差異。例如:一項研究追蹤了某種類型的細胞是否有助于腫瘤的血液供應。跟蹤這些細胞需要它們表達“報告”分子(即綠色熒光蛋白)。但是盡管進行多次嘗試和調(diào)整,復現(xiàn)團隊仍無法使綠色熒光蛋白報告基因在要跟蹤的細胞中充分表達,因此復現(xiàn)實驗被停止。

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      圖:綠色熒光蛋白報告分子(右下角)

      努力與進步
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      自項目開始以來,學界作出許多努力,以鼓勵作者分享更精確的研究方法學細節(jié)。例如:①Nature與其他期刊于2013年推出了可重復性檢查表。要求作者報告關(guān)鍵實驗數(shù)據(jù),例如所用動物的品系、年齡和性別。②還鼓勵作者將實驗協(xié)議存放在公共庫中,以便其他研究人員訪問。③于 2012 年發(fā)布Landis 4”標準,以促進嚴格的動物研究。它們包括對盲法、隨機化和統(tǒng)計評估樣本量的要求。④發(fā)布注冊報告,這也是研究人員在進行實驗之前發(fā)布研究設(shè)計的一種文章格式。這意味著陰性結(jié)果”更有可能被發(fā)布。項目團隊發(fā)現(xiàn)陰性結(jié)果(Original null)更有可能被復現(xiàn)。

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      圖:陰性結(jié)果更容易被重復,陽性結(jié)果則較難重復。

      來源doi: https:///10.1038/d41586-018-07118-1

      此外,美國國防高級研究計劃局 (DARPA)還增設(shè)獨立的驗證團隊,研究團隊必須協(xié)助并支持驗證團隊獲得同樣的關(guān)鍵結(jié)果,才能發(fā)表工作。不過此類驗證需要額外分配3-8%的科研資金,所以廣泛實施難度也較大。未來也需要尋找更多解決方法。

      總結(jié)

      復現(xiàn)結(jié)果不是單純?yōu)榱藦同F(xiàn),而是為了獲得對科學進步至關(guān)重要的保證。小編認為文章可重復性是一個大趨勢,也就意味著發(fā)文章會越來越嚴格。目前高分文章都要求至少三組獨立重復實驗證明一個結(jié)論,發(fā)表文章的同時還要提交細胞系、動物品系等的檢測報告,要求來源可控,無支原體污染等等。捫心而論,目前能夠做到嚴格管控的實驗室還較少,但未來是一個大趨勢,科研群眾吃瓜同時,也需要慢慢提高意識,重視實驗的可重復性,為未來的數(shù)據(jù)驗證打下堅實的基礎(chǔ)。

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      END

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