克隆性造血（clonal hematopoiesis）是一種特殊的生物學(xué)過程，其中一個造血干細胞（能產(chǎn)生多種細胞類型的細胞群）能獲得有利的突變并超越附近的細胞；當(dāng)這種突變在某一特定個體機體中存在于2%的血細胞中時，克隆性造血就能被診斷出來，而驅(qū)動克隆性造血的優(yōu)勢突變則處于正向選擇之下，就好像癌癥基因的突變會導(dǎo)致細胞發(fā)生惡變一樣。

近日，一篇發(fā)表在國際雜志Nature Communications上題為“Discovering the drivers of clonal hematopoiesis”的研究報告中，來自西班牙巴塞羅那生物醫(yī)學(xué)研究院等機構(gòu)的科學(xué)家們通過研究重新定向了一種最初在癌癥基因組研究領(lǐng)域設(shè)計的計算工具，旨在揭示驅(qū)動克隆性造血的基因，這一策略背后的原理是，癌癥和克隆性造血的發(fā)生都受到了正向選擇的影響，因此，如果進行適當(dāng)調(diào)整的話，用于識別癌癥驅(qū)動基因的工具和數(shù)據(jù)集或許都能推進克隆性造血的研究。

首先，為了確定血細胞中的體細胞突變，研究人員顛覆了在癌癥中使用的方法，即利用癌癥患者血細胞的基因組來作為參考識別腫瘤樣本中的體細胞突變；相反，他們進行了一種“反向調(diào)用”（reverse calling），也就是說，他們利用腫瘤基因組作為參考來識別血細胞基因組中存在的體細胞突變，這些血細胞或許還能因克隆性造血而被擴大，應(yīng)用研究人員所開發(fā)的綜合性腫瘤基因組管線（Integrative OncoGenomics pipeline），他們就能利用這些血液體細胞突變來識別克隆性造血在正向選擇下的基因。

科學(xué)家開發(fā)出一種能揭示驅(qū)動克隆性造血基因的新型計算工具。

圖片來源：IRB Barcelona

60年前，科學(xué)家們首次發(fā)現(xiàn)了克隆性造血，但完全理解驅(qū)動這一障礙的所有基因?qū)τ谘芯咳藛T或許存在一定困難，這項研究中，研究人員提出了一種新方法，其或能幫助識別其驅(qū)動基因的目錄，從而幫助早期檢測人群中的克隆性造血。如今，克隆性造血日漸成為全球人群的健康問題，其是一種與機體衰老密切相關(guān)的過程，進行化療治療的癌癥患者更易于出現(xiàn)克隆性造血這種狀況。研究者Oriol Pich說道，在此前研究中，我們分析了癌癥療法下血細胞的進化情況，他們觀察到，盡管在化療暴露之前克隆性造血就已經(jīng)發(fā)生了，但療法或許會促進這一過程的進行。

盡管克隆性造血并不是一種疾病，但其會增加個體后期患惡性血液腫瘤和多種心血管疾病的可能性或風(fēng)險，因此，早期診斷以及后續(xù)的監(jiān)測是早期且適當(dāng)監(jiān)測和管理相關(guān)并發(fā)癥的關(guān)鍵。目前研究人員正在參與兩個研究項目，旨在評估克隆性造血對健康人群的影響，尤其是在動脈粥樣硬化和心肌梗塞方面，綜上，本文研究結(jié)果表明，研究人員開發(fā)的新方法或能恢復(fù)克隆性造血基因，同時他們還發(fā)現(xiàn)了其它的候選基因。（生物谷Bioon.com）

原始出處：

Pich, O., Reyes-Salazar, I., Gonzalez-Perez, A. et al. Discovering the drivers of clonal hematopoiesis. Nat Commun 13, 4267 (2022).doi：10.1038/s41467-022-31878-0