1、蘆廟站，是亳州市區(qū)的一個高鐵站，站房面積為3000平米，是商合杭高鐵的一個站點。

2、亳州南站，位于亳州南部新區(qū)，是商合杭高鐵在亳州市區(qū)設立的一個站點，也是商合杭高鐵入皖第一大站。

3、古城東站，位于毫州市譙城區(qū)古城鎮(zhèn)，站房面積3000平方米，也是商合杭高鐵的一個站點。

4、太和東站，位于太和縣趙集鄉(xiāng)境內，站房面積15000平方米，是商合杭高鐵的一個站點。

5、阜陽西站，位于阜陽市潁州區(qū)，站場設計為10臺18臺面22線，其中商合杭（京九）車場8臺面10線，鄭阜車場5臺面7線，城際車場5臺面5線。隨著商合杭高鐵、鄭阜高鐵這兩條鐵路的實施，阜陽將結束無高鐵的歷史。

6、潁上北站，位于潁上縣十八里鋪鎮(zhèn)邢洋村，站房總建筑面積21005平方米，其中鐵路站房面積14984平方米，架空層開發(fā)面積6021平方米，是商合杭高鐵經過城市中最大的縣級站之一。

7、鳳臺南站，位于鳳臺縣毛集實驗區(qū)合淮阜高速毛集出口東側約1公里，站房建筑面積8000平方米，車站站房為架空的線側平式布置，共有2個側式站臺，到發(fā)線4條(含正線)。

8、壽縣站，位于壽縣古城北門外，站房面積10000平方米，造型設計主題為“楚都壽春，漢闕迎賓”。方案取楚都之神，借漢闕之靈。屋面以楚都宮殿的神韻，營造現(xiàn)代建筑的莊重。主入口兩側對稱的漢闕，典雅靈動，給旅客以賓至如歸的感受。建筑整體形象大氣穩(wěn)重，以簡潔靈動的建筑語匯描繪楚都的悠遠意境。

9、淮南南站，位于淮南市山南新區(qū)，是淮南市的第二座高速鐵路專用車站，在此之前淮南市已有合蚌高速鐵路客運專線淮南東站已于2012年10月16日正式開通運營。

10、柘皋站，位于巢湖市柘皋鎮(zhèn)境內南部，本來叫“巢湖北站”，后改為“柘皋站”，定位為國鐵高速干線中間站，還將成為巢北新城及環(huán)巢湖旅游休閑區(qū)重要客運樞紐。

11、含山南站，位于含山縣銅閘鎮(zhèn)山馬村以東，站房按地市級標準規(guī)劃設計，站房面積5000平方米，投資約6000 萬元；站前廣場占地面積60畝，有公交停車場和私家車停車場等。

12、蕪湖北站，地處蕪湖市鳩江區(qū)湯溝鎮(zhèn)，站房面積5000平方米，是商合杭高鐵的一個站點。

13、廣德南站，站房面積12000平方米，是商合杭高鐵在安徽境內的最后一站。

14、新安慶西站，位于安慶市茶嶺鎮(zhèn)附近，是合安九高鐵上的重要樞紐站點，也是規(guī)劃中的皖西南重要綜合交通樞紐站點，合安九、阜景、北沿江三線交匯、大宜城兩大城際樞紐之一。

15、潛山南站，位于潛山市油壩鄉(xiāng)東店，站房規(guī)模15000平方米，離潛山城區(qū)7公里，是合安九高鐵的一個車站。

16、太湖南站，位于太湖縣新倉鎮(zhèn)沙壩村，是合安九高鐵線路上的一個車站。

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