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      近5年發(fā)表NP/PNAS/PC等10篇,華中農(nóng)大嚴(yán)順平組將研究成果寫進(jìn)教科書

       昵稱37581541 2022-04-24

      異彩紛呈的植物世界,深藏著令人神往的奧秘,吸引著眾多科學(xué)家為之不懈奮斗。

      作為我國植物DNA損傷應(yīng)答機(jī)理研究領(lǐng)域的開拓者,華中農(nóng)業(yè)大學(xué)生命科學(xué)技術(shù)學(xué)院嚴(yán)順平教授團(tuán)隊(duì)八年磨一劍,成功填補(bǔ)了該研究領(lǐng)域多項(xiàng)空白,極大地推動了人類對植物DNA 損傷應(yīng)答的認(rèn)識。

      一系列成果的背后,有著怎樣的攻關(guān)故事?  

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      嚴(yán)順平老師在實(shí)驗(yàn)室(受訪者 供圖)

      “寧肯難一些,也要填補(bǔ)有意義的空白!

      1978年,嚴(yán)順平出生在杭州市淳安縣的一個小村莊,受身邊老師的影響,從小他便立志成為一名科學(xué)家。

      機(jī)緣巧合之下,嚴(yán)順平在大一時就進(jìn)入植物學(xué)實(shí)驗(yàn)室開展研究,從此便與植物學(xué)研究結(jié)下不解之緣,也是這段科研經(jīng)歷,點(diǎn)燃了他探索植物奧秘的欲望。

      2001年,嚴(yán)順平考入中國科學(xué)院上海植物生理生態(tài)所攻讀博士學(xué)位。博士畢業(yè)后,一心渴望科研報國的嚴(yán)順平選擇前往美國杜克大學(xué)生物系深造。出國的那天,身為共產(chǎn)黨員的嚴(yán)順平告訴自己:“一定要學(xué)成歸來,為祖國科技自立自強(qiáng)貢獻(xiàn)自己的一份力量?!?/p>

      博士后期間,嚴(yán)順平不僅攻克了“水楊酸受體”這一學(xué)界公認(rèn)的難題,還成功揭開了一個未知功能基因SNI1的“分子身份”,相關(guān)研究成果發(fā)表在Nature(共同第一作者)、Molecular Cell 等雜志。

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      嚴(yán)順平老師與學(xué)生一起查看擬南芥長勢(匡敏 攝)

      2014 年,博士后出站的嚴(yán)順平在眾多高校和研究所中選擇了華中農(nóng)業(yè)大學(xué)。彼時,已在“植物抗病機(jī)理”領(lǐng)域嶄露頭角的嚴(yán)順平,卻作出了一個“令人不解”的決定——開辟“植物DNA損傷應(yīng)答機(jī)理”這一新的研究方向。

      所有生物的最終目標(biāo)是把正確的遺傳信息(DNA)傳遞給下一代,但 DNA會不斷地受到各種外源和內(nèi)源因素?fù)p傷,如果這些損傷不能被修復(fù),就會導(dǎo)致基因組不穩(wěn)定,并影響復(fù)制和轉(zhuǎn)錄這兩個重要的生物學(xué)過程。在生物學(xué)研究領(lǐng)域,“DNA 損傷應(yīng)答”是一個非常重要的基礎(chǔ)生物學(xué)問題,也是生命科學(xué)的前沿領(lǐng)域之一。而那時,全球范圍內(nèi)開展植物DNA損傷應(yīng)答相關(guān)研究的實(shí)驗(yàn)室還為數(shù)不多。

      在嚴(yán)順平看來,在動物體中,DNA 損傷應(yīng)答機(jī)制的缺陷會導(dǎo)致很多疾病,包括絕大部分的癌癥。與動物不同,植物體內(nèi)的 DNA 損傷非常頻繁,但是植物不會“得癌癥”,這表明植物進(jìn)化了特殊的DNA 損傷應(yīng)答機(jī)制。與動物的研究相比,植物 DNA 損傷應(yīng)答機(jī)制的研究還比較有限,很多重要的科學(xué)問題亟待解決。

      “雖然開辟這一新方向意味著探索之路更為艱辛,但科研就是要真正填補(bǔ)一些有意義的空白,拓寬人類認(rèn)知的邊界?!边@是嚴(yán)順平開辟新方向的初衷。

      帶著這份初心,嚴(yán)順平帶領(lǐng)團(tuán)隊(duì)開始了艱難的探索。

      “將研究成果寫進(jìn)教科書”

      “基礎(chǔ)研究是科技創(chuàng)新的源頭,要敢于實(shí)現(xiàn)從0到1的突破,爭取將研究成果寫進(jìn)教科書?!边@是嚴(yán)順平與團(tuán)隊(duì)師生們共同的心愿。

      這個心愿,也一直激勵著團(tuán)隊(duì)師生們在科研之路上砥礪前行。

      回憶起科研探索的歷程,嚴(yán)順平課題組第一位博士后王利利對剛進(jìn)組時的情形依然記憶猶新?!耙?yàn)榭蓞⒖嫉奈墨I(xiàn)資料非常少,實(shí)驗(yàn)室也尚未建立成熟的研究體系,早期的研究如同在黑夜中摸索?!?/p>

      讓王利利印象最為深刻的,要屬研究“植物ATR-WEE1激酶模塊激活細(xì)胞周期停滯機(jī)制”的那段經(jīng)歷。

      長期以來,植物ATR 和 WEE1 如何激活細(xì)胞周期停滯是一個懸而未決的科學(xué)問題,也是嚴(yán)順平一直想攻克的一個難點(diǎn)。

      在順利完成系列表型解析實(shí)驗(yàn)后,本來信心滿滿的王利利卻在ATR 和 WEE1的互作機(jī)制研究方面“卡殼”了。

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      嚴(yán)順平老師與學(xué)生探討激光共聚焦實(shí)驗(yàn)結(jié)果(匡敏 攝)

      “那陣子,嚴(yán)老師帶著我們不斷提出假設(shè)、驗(yàn)證,但沒有一條路可以走通?!蓖趵寡裕瑲v經(jīng)數(shù)十次驗(yàn)證失敗后,自己甚至懷疑過嚴(yán)老師選擇這一研究方向的合理性,好在有嚴(yán)老師一次次的鼓勵,自己才堅(jiān)定了做下去的決心。

      轉(zhuǎn)機(jī)出現(xiàn)在一次磷酸化實(shí)驗(yàn)結(jié)果出來之后,細(xì)心的王利利將一個微小的變化“揪”了出來,后續(xù)的難點(diǎn)也被一舉攻破。

      這項(xiàng)研究不僅“打通”了植物 ATR-WEE1 信號通路,首次闡明了植物 ATR-WEE1 激酶模塊激活細(xì)胞周期停滯的機(jī)制,對利用 WEE1 抑制劑治療癌癥也具有指導(dǎo)意義。相關(guān)研究成果發(fā)表在 Nature Plants 和 Nucleic Acids Research 雜志。

      看到論文接收函的那一刻,王利利激動不已。她動情地說,“感謝嚴(yán)老師的堅(jiān)持,帶我沖破思想桎梏,筑牢科研信念?!?/p>

      讓研究團(tuán)隊(duì)興奮的不止于此。這兩項(xiàng)研究成果中,發(fā)表在 Nature Plants 的論文入選了 ESI 高被引論文,歐洲科學(xué)院院士 Pascal Genschik 的綜述論文系統(tǒng)地介紹了這兩項(xiàng)工作,并將其總結(jié)在工作模型中,植物細(xì)胞周期調(diào)控的權(quán)威專家 Lieven De Veylder 也在綜述論文中把這兩項(xiàng)工作總結(jié)在工作模型中。

      至此,團(tuán)隊(duì)邁出了重要一步。

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      嚴(yán)順平與學(xué)生一起討論實(shí)驗(yàn)結(jié)果(匡敏 攝)

      團(tuán)隊(duì)的“雄心壯志”遠(yuǎn)不止于此。

      DNA雙鏈斷裂是最嚴(yán)重的DNA損傷形式。同源重組修復(fù)(HR)是精準(zhǔn)修復(fù)DNA雙鏈斷裂的主要機(jī)制,也是利用基因組編輯工具進(jìn)行基因打靶的基礎(chǔ),但植物的基因打靶的效率很低。

      “同源重組修復(fù)效率低是限制基因打靶的關(guān)鍵因素之一,要提高基因打靶效率就必需搞清楚植物調(diào)控同源重組修復(fù)的機(jī)制!”2016年,這一想法在嚴(yán)順平腦海中浮現(xiàn)。

      經(jīng)過反復(fù)推敲后,嚴(yán)順平漸漸意識到,已有的植物DNA損傷應(yīng)答研究大多借鑒動物模式,但植物在進(jìn)化過程中形成了特殊的DNA損傷應(yīng)答機(jī)制,光借鑒動物模式可能會忽略植物所特有的基因。

      “利用模式植物擬南芥的優(yōu)勢,從遺傳篩選入手,會不會發(fā)現(xiàn)植物特有的DNA損傷修復(fù)基因?”帶著這份期許,嚴(yán)順平帶領(lǐng)團(tuán)隊(duì)開始了一次全新的嘗試。

      經(jīng)過大量的遺傳篩選,團(tuán)隊(duì)成功發(fā)現(xiàn)了對DNA損傷試劑超敏感的DDRM1突變體。這個突變體的發(fā)現(xiàn),讓嚴(yán)順平興奮起來。

      然而,DDRM1是植物特有的蛋白,沒有動物中相關(guān)研究的參考,因此,要解析它的作用機(jī)制也并非易事。

      研究團(tuán)隊(duì)決定從尋找DDRM1的互作蛋白著手,這也是博士后王軒鵬接手課題后要攻克的第一個難點(diǎn)。

      由于植物中DDRM1蛋白的水平很低,在已公布的蛋白組數(shù)據(jù)中,都沒有它的“身影”,這無疑讓本就“撲朔迷離”的探索更加艱難。團(tuán)隊(duì)在嘗試了常用的串聯(lián)親和純化+質(zhì)譜、酵母雙雜篩選等方法后,竟沒有一個方法奏效,課題也一度陷入了停滯。

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      嚴(yán)順平與博士后王軒鵬討論論文撰寫(匡敏 攝)

      轉(zhuǎn)錄因子SOG1是植物DNA損傷應(yīng)答的核心蛋白之一,被認(rèn)為是動物抑癌蛋白p53的同功能蛋白。自從2009年首次被發(fā)現(xiàn)后,SOG1就成為了植物DNA損傷應(yīng)答研究中的一個“明星基因”。

      “DDRM1和SOG1都是植物特有蛋白,都參與DNA損傷應(yīng)答,那它們之間會不會有互作呢?我們可以試一下?!眹?yán)老師在組會上的這一猜想,讓陷入停滯的課題迎來了轉(zhuǎn)機(jī)。

      類似的“神猜想”不止這一次。為了打開DDRM1和SOG1互作的這一“黑箱”,王軒鵬已記不清與嚴(yán)老師提出過多少個模型,也記不得做了多少次驗(yàn)證實(shí)驗(yàn)。就這樣,一個個“硬骨頭”被一一砸開。

      團(tuán)隊(duì)最終發(fā)現(xiàn),DDRM1能夠單泛素化SOG1并提高SOG1的蛋白穩(wěn)定性。這一研究不僅開辟了研究植物DNA損傷應(yīng)答的新模式,也發(fā)現(xiàn)了植物調(diào)控同源重組修復(fù)的特有模塊DDRM1-SOG1,揭示了植物調(diào)控同源重組修復(fù)的新機(jī)制,為利用同源重組修復(fù)機(jī)制提高基因打靶效率提供了新方向,相關(guān)研究成果發(fā)表在國際期刊PANS上。

      “搞科研如同破案,其樂無窮”

      在團(tuán)隊(duì)師生眼里,嚴(yán)順平老師總是面帶笑容,聲音溫和而堅(jiān)定,身上似乎有股打不垮的韌勁。在大家看來,這份堅(jiān)定與韌勁,也許是嚴(yán)老師在長期的基礎(chǔ)研究中“修煉”而來。

      基礎(chǔ)研究往往需要經(jīng)歷一個“大浪淘沙”的過程,不僅周期長、見效慢、投入大,失敗也是家常便飯,成功反而難得一見。而這般的“苦”日子,嚴(yán)順平卻品出了別樣的甘甜。

      “科研真正的樂趣,不是發(fā)論文,而是'破案’ 。從細(xì)致的觀察中發(fā)現(xiàn)蛛絲馬跡,再根據(jù)現(xiàn)象自我發(fā)問,不斷推理,提出假設(shè),再進(jìn)行驗(yàn)證,環(huán)環(huán)相扣,揭秘隱藏在現(xiàn)象背后的科學(xué)本質(zhì),過程雖辛苦,但'破案’的成就感也其樂無窮。”崇尚快樂科研的嚴(yán)順平分享著他的工作感受。

      走進(jìn)嚴(yán)順平老師的辦公室,一張寫滿實(shí)驗(yàn)?zāi)P偷陌装逵橙胙酆?,這里,便是嚴(yán)老師時常與同學(xué)們一起“探案”的地方。

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      嚴(yán)順平老師與學(xué)生一起在白板上“探案”(匡敏 攝)

      每次成功“破案”背后,都是一段夜以繼日奮戰(zhàn)的征途。

      多年的科研生涯,嚴(yán)順平主持和參與完成的7項(xiàng)科研課題,都是鮮為人知的“寂寞長跑”。而每當(dāng)遇到問題,嚴(yán)順平都會平心靜氣地和團(tuán)隊(duì)成員一點(diǎn)一點(diǎn)分析,一項(xiàng)一項(xiàng)攻關(guān)。

      嚴(yán)老師的默默堅(jiān)守,也在潛移默化間感染著身邊的每一個人。

      王軒鵬說:“每當(dāng)我們在科研中感覺'走投無路’時,嚴(yán)老師總能帶領(lǐng)我們披荊斬棘、穿越黑暗,向著未知不斷前行?,F(xiàn)在,我們團(tuán)隊(duì)師生都是'崇嚴(yán)粉’?!?/p>

      近五年來,在嚴(yán)順平的帶領(lǐng)下,團(tuán)隊(duì)陸續(xù)在Nature Plants、PNAS、Nucleic Acids Research、Plant Cel l等雜志發(fā)表10篇論文,引起了同行的高度關(guān)注。

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      嚴(yán)順平老師與團(tuán)隊(duì)師生在一起(受訪者 供圖)

      憑借在植物 DNA 損傷應(yīng)答方面的成績,嚴(yán)順平也多次受邀在 DNA 損傷應(yīng)答領(lǐng)域的國際會議上做口頭報告。他用一項(xiàng)項(xiàng)出色的工作,讓世界聽到了中國科學(xué)家的聲音。

      從最初在黑暗中摸索,到研究成果蜚聲國際,已經(jīng)進(jìn)入豐產(chǎn)期的嚴(yán)順平更加篤定,他說:“未來,我們期待向科學(xué)界展示植物特有DNA損傷應(yīng)答網(wǎng)絡(luò)全貌,填補(bǔ)更多基礎(chǔ)研究空白,為國家科技自立自強(qiáng)貢獻(xiàn)更大的力量。”

      來源:華中農(nóng)業(yè)大學(xué)報

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